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苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒orf129基因敲除实验的中期报告
本实验旨在通过敲除苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(Alfalfa mosaic virus, AMV)orf129基因,探究该基因在AMV感染过程中的作用及其对寄主植物的影响。本文是该实验的中期报告,主要介绍实验设计、方法和进展。
实验设计
本实验选取AMV-Cg和苜蓿(Medicago sativa)为实验对象,通过CRISPR/Cas9技术敲除AMV的orf129基因,构建AMV的orf129基因缺失体系。比较AMV-Cg和AMV-Cg?orf129在苜蓿上的生长和病毒繁殖能力,并研究orf129基因的敲除对AMV感染苜蓿的影响。
方法
1.设计sgRNA:根据AMV-Cg段的序列,选择了orf129基因内部作为目标位点,设计了两个sgRNA,通过连接大肠杆菌质粒pRGEB32中的Cas9 nuclease融合蛋白,形成CRISPR-Cas9质粒。经过测序确定sgRNA的准确性并进行扩增和电泳检验。
2.转化大肠杆菌DH5α:将CRISPR-Cas9质粒转化至大肠杆菌DH5α中,筛选经过鉴定的正式菌株进行后期的质粒提取、纯化和测序。
3.烟草悬浮细胞转化:从AMV-Cg中提取RNA后,构建cDNA文库,并进行限制酶切,将ORF129基因序列下游添加构建clone,得到orf129缺失的AMV-Cg。将Control和orf129缺失的AMV-Cg构建为植物半微型载体,并转化进烟草悬浮细胞。
4.苜蓿转化:将编码AMV-Cg和orf129缺失的AMV-Cg的载体转化至Agrobacterium tumefaciens中,进行菌液感染和接种,获得转化植株。
进展
在本实验中,我们已经完成了CRISPR/Cas9质粒的构建以及大肠杆菌DH5α的转化工作,并通过对CRISPR/Cas9质粒和大肠杆菌的培养和鉴定,确保了菌株和质粒的质量。同时,我们也已经从AMV-Cg中提取RNA并构建了cDNA文库,得到了orf129基因缺失的AMV-Cg,并通过电泳检测确定DNA片段长度和纯度。下一步的工作是将Control和orf129缺失的AMV-Cg构建为植物半微型载体,并进行烟草悬浮细胞与苜蓿的转化,为后期的实验打下基础。
结论
本实验旨在探究AMV的orf129基因在植物中的作用及其对植物的影响,通过CRISPR/Cas9技术敲除AMV的orf129基因,构建AMV的orf129基因缺失体系。在实验进行的过程中,我们已经完成了CRISPR/Cas9质粒的构建、大肠杆菌DH5α的转化、RNA的提取和文库构建等工作,并获得了orf129基因缺失的AMV-Cg。我们将进一步完成植物转化和进一步实验,探究orf129基因在AMV感染过程中的作用及其对寄主植物的影响。
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