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家蚕基因组中50-500nt非编码RNA的发现鉴定及表达谱研究的中期报告
本研究的目的是在家蚕基因组中鉴定和研究50-500nt长度的非编码RNA(ncRNA),以探索它们在家蚕发育和生长中的作用。
在研究的早期阶段,我们测序了家蚕的转录组,得到了大量的RNA序列数据。接着,我们使用生物信息学方法对这些序列进行分析,鉴定出了一批50-500nt长度的ncRNA。其中包括已知的RNA种类,如长链非编码RNA(lncRNA)、转录本末端小RNA(TEsRNA)等,也包括一些新发现的RNA。
针对这些ncRNA,我们进一步使用qPCR、Northern blot和RNA-seq等技术进行表达谱分析,发现它们在家蚕不同发育阶段、组织和生理状态下表达具有明显差异。特别是一些新发现的RNA在特定的组织或发育阶段的表达极为显著,说明这些RNA在家蚕的生长发育中可能扮演着重要角色。
进一步分析显示,鉴定出的ncRNA与家蚕的基因表达调控、代谢物质合成等生物学过程密切相关。我们将继续深入挖掘这些ncRNA的功能和调控机制,为揭示家蚕基因组的功能谱提供更为完整的图谱。
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