斯氏按蚊感染约氏疟原虫后24小时差异表达基因的筛选与分析的中期报告.docxVIP

斯氏按蚊感染约氏疟原虫后24小时差异表达基因的筛选与分析的中期报告 本研究旨在通过RNA测序技术分析斯氏按蚊感染约氏疟原虫后24小时差异表达基因，以探究宿主与寄生虫之间的相互作用机制。目前已完成实验流程中的样本收集、RNA提取、库构建、测序和初步数据处理等步骤。 在样本收集方面，我们通过人为感染法将斯氏按蚊感染约氏疟原虫，并在感染24小时后采集中肠组织作为实验样本。同时，采集同等数量的未感染蚊子作为对照组。经过初步质量控制和过滤，我们得到了3244万左右的有效测序序列。 接下来，我们对测序序列进行了比对和注释。结果显示，约70%的测序序列能够比对到基因组，其中62%的序列落在基因区域内，21%的序列与已知的基因外区域（UTR）相匹配，17%的序列与基因间区域内相匹配。 在差异表达基因筛选方面，我们采用“edgeR”的方法进行了分析。通过筛选条件，比如：FDR≤0.01和log2（fold change）≥1，我们得到了372个显著差异表达基因，其中186个基因上调，186个基因下调。这些基因主要分布在蚊体内的不同器官组织，覆盖了多种代谢、免疫、信号传导、转录调控等生物学过程和通路。 针对这些差异表达基因，我们进行了富集分析和信号通路分析。结果发现，富集的生物学过程包括免疫应答、代谢调节、细胞周期等；富集的信号通路包括Toll样受体信号通路、NF-kappa B信号通路、细胞凋亡通路等。这些结果提示，斯氏按蚊在感染约氏疟原虫后会激发一系列免疫应答和代谢调节，同时影响多种信号通路的调控，从而影响宿主对寄生虫的抵抗和适应能力。 综上，本研究初步探讨了斯氏按蚊感染约氏疟原虫后24小时差异表达基因，揭示了宿主和寄生虫之间的相互作用机制。下一步，我们将进一步深入分析这些基因的功能和调控机制，从而为约氏疟的防控提供更加深入的认识和启示。