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- 2023-10-28 发布于广东
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* 本文档共52页;当前第31页;编辑于星期二\3点6分 * 三、蛋白质功能数据库 (三)STRING (二)DIP (一)BOND (四)KEGG * 本文档共52页;当前第32页;编辑于星期二\3点6分 (一)BOND BOND是生物分子网络数据库,创建于2005年,由Unleashed Informatics公司管理和维护。 主要收录生物分子及其蛋白质序列、结构和相互作用等数据,其中生物分子包括蛋白质、DNA、RNA、配基、复合体、基因、光子(photon)等。 BOND集成了多个重要数据库,如BIND(生物分子相互作用网络数据库)、SMID(小分子相互作用数据库)、Genbank、GO(基因本体)、OMIM、conserved domains(保守功能域)、交叉参考数据库、完整基因组等。 网址: * 本文档共52页;当前第33页;编辑于星期二\3点6分 BOND主页 * 本文档共52页;当前第34页;编辑于星期二\3点6分 (二)DIP DIP专门存放实验确定的蛋白质之间相互作用的数据,既包括经典实验手段确定的蛋白质相互作用,也包括高通量实验手段确定的蛋白质相互作用数据。 数据要经过人工审核和采用计算方法自动验证后加入数据库。数据的自动验证有3种指标,即EPR Index、PVM Score和DPV Score。 在目前缺乏蛋白质相互作用数据金标准的
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