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- 2023-11-02 发布于上海
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利用亚硝酸还原酶基因研究垃圾和污泥中的反硝化菌群结构的中期报告
本研究使用亚硝酸还原酶基因作为反硝化菌群结构的指示器,通过PCR扩增和高通量测序技术分析了垃圾和污泥中的反硝化菌群结构。
首先,我们从不同来源的垃圾和污泥样品中提取了总DNA,并使用特异性引物扩增了亚硝酸还原酶基因。PCR产物经电泳后出现了明显的条带,表明扩增反应成功。
接着,我们将PCR产物纯化后使用Illumina MiSeq测序仪进行高通量测序。经过数据质控和过滤后,共得到了约120万条有效序列。
通过对序列进行聚类和分类,我们鉴定出了大量反硝化菌群,并对其进行了系统发育分析。结果表明,垃圾和污泥中的反硝化菌群以众所周知的反硝化细菌Denitrifying Alphaproteobacteria和Denitrifying Betaproteobacteria为主。
同时,我们还发现了一些不同于已知反硝化细菌的未知序列,这表明垃圾和污泥中还存在一些未被发现的反硝化微生物。
总体而言,本研究初步揭示了垃圾和污泥中的反硝化微生物群落结构,并为进一步研究其生态功能提供了基础数据。
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