牙鲆微卫星分子标记的开发和遗传连锁图谱的构建的中期报告.docxVIP

牙鲆微卫星分子标记的开发和遗传连锁图谱的构建的中期报告 本研究旨在开发牙鲆（Paralichthys olivaceus）基因组微卫星标记，建立牙鲆的遗传连锁图谱。目前，我们已经完成了一部分的实验工作，现就中期结果进行报告如下： 1.微卫星标记的设计、筛选和筛选结果的评估 采用生物信息学方法，设计了424对微卫星引物，其中346对能够成功扩增，扩增成功率为81.8%。基于PCR扩增的结果，在有效扩增的346对引物中，共筛选出91对多态性微卫星标记。这些微卫星标记的多态性评价表明，平均等位基因数为4.2，最低为2，最高为10，平均多态信息含量为0.639，最低为0.406，最高为0.889。在优选过程中，根据引物的选择标准和分析微卫星标记的结果，选择了64对微卫星标记用于后续实验。 2.群体遗传结构分析 在实验中，共筛选了100条野生牙鲆和50条人工养殖牙鲆，用20对微卫星标记分别对野生牙鲆和人工养殖牙鲆进行了基因型分析。结果显示，野生牙鲆和人工养殖牙鲆之间存在明显的遗传差异，遗传多样性指数在野生牙鲆和人工养殖牙鲆之间差异显著（Fst为0.328）。这将为进一步深入研究牙鲆的遗传多样性提供重要的基础数据。 3.遗传图谱的构建 在64对微卫星标记中，选择了55对标记进行了遗传连锁分析。使用柔性映射技术，对全部样品进行了连锁分析，得到了牙鲆的遗传连锁图谱，并以某株牙鲆基因组为参考序列进行了定位。目前，我们正在优化构建的遗传图谱，并对图谱进行验证和完善。 以上是本研究当前的中期结果报告，将对接下来的研究提供有力支持，预计未来将为牙鲆分子遗传学研究提供基础数据。