基于HCV6Kb扩增子的动态准种优势株的确定及包膜2基因正选择位点分析的中期报告.docxVIP

基于HCV6Kb扩增子的动态准种优势株的确定及包膜2基因正选择位点分析的中期报告 这篇科技报告的主旨是确定从HCV6Kb扩增子中找到的动态准种优势株，并分析其包膜2基因正选择位点。该研究的方法包括通过PCR扩增HCV6Kb序列，克隆和测序得到扩增物序列，利用MEGA4软件进行分析，构建进化树，并确定主要分支的动态准种优势株。接下来，利用基因序列片段进行正选择位点分析，并使用FUBAR分析进行橙色苏木素染色验证。 通过对HCV6Kb扩增子的分析，鉴定出了3个最相关的分支，即A1，A2和B1。根据进化树分析，确定A1，A2和B1株系分别为动态准种优势株。接下来，通过基于包膜2基因序列进行正选择位点分析，得出了11个显著的正选择位点。然后，通过橙色苏木素染色验证的结果表明，在这些位点中，有8个可以揭示出包膜2蛋白的高度保守性及其作为疫苗目标的可行性。 综上所述，该研究成功鉴定了基于HCV6Kb扩增子的动态准种优势株，并确定了该优势株的包膜2基因正选择位点，这对于HCV的研究和疫苗开发具有重要意义。