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转录终止因子PDE191调控拟南芥rpoA基因的转录终止的中期报告
转录终止是细胞中基因转录过程的重要调控步骤之一。在细菌中,转录终止主要由转录终止因子(terminator factor)调控,而在真核生物中,转录终止由转录终止因子及具有特异性结构的终止序列共同调控。拟南芥(Arabidopsis thaliana)是一种常用的模式植物,研究其转录终止机制有助于深入理解植物基因表达的调控。
近年来,研究表明,拟南芥PDE191基因编码的蛋白质可调控拟南芥基因转录终止,但其调控机制尚不清楚。在本研究中,我们使用了拟南芥rpoA基因作为转录活性模型,探究了PDE191蛋白质在rpoA基因转录终止中的作用和调控机制。
初步实验结果显示,PDE191基因敲除株系(pde191-1)的rpoA基因转录水平显著高于野生型株系,表明PDE191蛋白质对rpoA基因转录终止具有调控作用。进一步实验结果表明,PDE191蛋白质可能通过结合rpoA基因外显子-内含子边界上的多肽序列,影响RNA聚合酶的结构和功能,从而调控rpoA基因的转录终止。我们还使用了转录组学方法对野生型和pde191-1株系的基因表达差异进行了分析,发现与rpoA基因正常转录有关的基因在pde191-1株系中表达异常,进一步证实了PDE191蛋白质在rpoA基因转录终止中的重要作用。
在今后的研究中,我们将继续深入探究PDE191蛋白质调控拟南芥基因转录终止的分子机制,并研究其在植物生长发育、应对逆境等方面的生物学功能。
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