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本发明属于生物技术领域，公开了一种构建DNA序列预训练语言模型的方法及其应用。所述方法包括：1)将预训练基因组数据以一个步长滑动获得预训练DNA序列片段；2)对所述预训练DNA序列片段进行K‑mers处理，获得K‑mers索引序列；3)借助掩码语言建模方式对K‑mers索引序列进行序列语义建模，获得DNA预训练语言模型。本发明还包括利用所述方法构建的DNA序列预训练语言模型以及经有监督微调得到预测模型。所述预测DNA序列包括启动子预测、启动子‑增强子互作预测、染色质特征状态预测或非编码变异效应预
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 117012280 A
(43)申请公布日 2023.11.07
(21)申请号 202210458388.4 G06N 3/0464 (2023.01)
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