高通量测序预测番茄miRNA与黄反花叶病毒侵染应答相关miRNA的变化的中期报告.docxVIP

高通量测序预测番茄miRNA与黄反花叶病毒侵染应答相关miRNA的变化的中期报告 本研究旨在利用高通量测序技术预测番茄植株在黄反花叶病毒（TYLCV）侵染后，miRNA表达的变化情况。本次中期报告主要介绍实验设计和初步结果。 实验设计 为了研究TYLCV侵染后miRNA的变化情况，本研究设计了两组实验，分别为TYLCV侵染组和对照组。TYLCV侵染组为番茄植株，在昼夜温度为25℃/18℃，湿度为60%的条件下，施加TYLCV病毒。对照组为未经过TYLCV病毒处理的番茄植株，其它条件与TYLCV侵染组相同。每组实验均有3个生物学重复。 初步结果 首先，我们利用Agilent 2100评估RNA完整性，发现样品RNA完整性良好，RIN值均在8以上。然后，利用TruSeq Small RNA Library Prep Kit对每个样品进行小RNA文库制备。对小RNA文库进行高通量测序，得到大量miRNA数据。 通过比对数据与番茄基因组，我们获得每个样品的miRNA表达数据，并且通过差异分析找出变化表达的miRNA。初步结果显示，TYLCV侵染组和对照组之间有大量miRNA表达的差异。TYLCV侵染组中许多miRNA表达上调，包括miR156、miR166和miR396等。同时，一些miRNA表达下调，例如miR482、miR6024和miR6478等。 结论 综上所述，我们利用高通量测序技术比较了TYLCV侵染组和对照组之间miRNA表达的差异，并初步分析了表达差异的miRNA。未来我们将深入研究这些miRNA的功能和机制，以期更好地理解番茄对TYLCV病毒的应答机制。