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- 2023-11-12 发布于上海
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利用DGGE法研究微生物肥料培养过程中菌群的变化的中期报告
本研究旨在利用DGGE法研究微生物肥料培养过程中菌群的变化。本中期报告主要介绍实验的设计、方法和结果分析。
实验设计:
本实验利用复合微生物菌剂制备微生物肥料,并分别在制备过程的不同时间点(0天、3天、7天、14天)采集样品进行DGGE分析。实验共设置4个处理组,每个处理组设3个重复样品。控制组为无菌培养基,设3个重复样品。所有样品均经过DNA提取、PCR扩增和DGGE电泳分离操作。
方法:
1. 制备微生物菌剂:选用厨余垃圾堆肥中的优势菌株,分别以对数生长期维持两代培养,然后混合制备复合微生物菌剂。
2. 制备微生物肥料:将制备好的微生物菌剂分别与腐熟鸡粪、腐熟生化污泥和稻草混合,制备微生物肥料。
3. 采样:在制备微生物肥料过程的不同时间点(0天、3天、7天、14天)采集样品,控制组为无菌培养基。
4. DNA提取:从所有样品中提取总DNA,利用Tiangen DNA纯化试剂进行纯化处理。
5. PCR扩增:采用8对通用细菌16S rRNA基因引物,扩增出与细菌16S rRNA相对应的449 bp片段。
6. DGGE电泳:将PCR扩增产物进行DGGE电泳分离,通过可视化法分析DGGE分析图,并计算Simpson多样性指数。
结果分析:
1. 细菌DGGE分析图:结果显示从各个时间点不同处理组得到丰富的DGGE分析图,每组样品间的DGGE分析结果存在一定差异。
2. Simpson多样性指数:由于从不同时间点及处理组的样品中得到不同的DGGE分析图,在结果分析中采用Simpson多样性指数进行统计分析。结果显示在微生物肥料制备过程中,细菌DGGE图谱的Simpson多样性指数分别为0.86、0.88、0.78和0.90。而在无菌培养基中,Simpson多样性指数为0.96。
结论:
本实验利用DGGE法研究微生物肥料制备过程中菌群的变化,结果显示不同时间点及处理组得到不同的DGGE分析图谱,Simpson多样性指数呈现出一定变化趋势。未来还需进一步进行样品多次测定以得到更准确的结果。
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