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- 2023-11-13 发布于上海
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FOXN1 DNA结合域介导的靶基因筛选及结构功能关系的研究的中期报告
尊敬的评审专家:
我作为研究生进行了一项关于FOXN1 DNA结合域介导的靶基因筛选及结构功能关系的研究,并在此提交中期报告。
研究背景:
Foxn1是一个重要的转录因子,对于胸腺发育和维护成熟T细胞的生存起着关键作用。它的DNA结合域是它的重要功能区域,在离子环境的调节下,可以与DNA结合并调控靶基因的表达。通过对FOXN1调控的靶基因的研究,可以更深入地了解FOXN1的生物学作用及分子机制。
研究内容:
我的研究主要分为以下两个部分:
1. 基于转染敲低FOXN1的T细胞系(Jurkat),通过RNA-seq技术筛选FOXN1调控的潜在靶基因,并进一步采用定量PCR技术验证和分析。
2. 通过分子生物学技术构建FOXN1的DNA结合域不同区域的突变体,并观察不同突变体对于特定DNA序列的结合能力,以及对于FOXN1调控靶基因表达的影响。
研究进展:
1. RNA-seq数据分析结果表明,FOXN1敲低后对于T细胞系中很多基因的表达水平有显著的影响,涉及到多个通路及信号通路相关的基因。我们已经在基因本体论术语的分析过程中发现了一些与T细胞发育相关的靶基因。
2. 对于FOXN1 DNA结合域不同区域的突变体的构建,我们已成功构建了两个特定区域的突变体,并已初步进行了转染和表达的验证。下一步将利用DNA结合实验
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