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本发明提供了一种计算单细胞RNA序列数据中细胞间相似性识别稀有细胞的方法，涉及生物信息、机器学习领域。我们将方法主要分为两个主要步骤：基于个体相似性的细胞分裂和基于群体相似性的稀有细胞检测。在第一步中，由于稀有细胞数量较少，在计算稀有细胞的廓清近邻(KNN)时，如果廓清足够大，KNN内的细胞可能会越过其他类型细胞的分布。这种分布变化会导致相似性的急剧变化。我们使用单个细胞基因表达空间中的欧氏距离来衡量细胞之间的相似性。然后，我们表征细胞与其最近邻的相似性(最近邻远大于稀有细胞的数量)，并将特
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 117037151 A
(43)申请公布日 2023.11.10
(21)申请号 202311185853.2
(22)申请日 2023.09.14
(71)申请人 中国石油大学（华东）
地址 26
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