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利用含时长程修正密度泛函理论研究DNA分子中的碱基、碱基对的激发态的开题报告
1. 研究背景
DNA分子是指由核苷酸单元重复连接组成的双螺旋结构,在生物学中具有非常重要的功能。DNA的结构和电子性质对于其功能十分关键,而其中的碱基对的激发态对于DNA的生物学过程也起着重要作用。近年来,随着计算机技术的发展和电子结构理论的不断成熟,利用密度泛函理论进行理论计算已成为研究DNA分子的重要手段之一。然而,由于传统的密度泛函理论没有考虑时间依赖性,因此难以准确描述系统的激发态。
2. 研究内容
本研究计划利用含时长程修正密度泛函理论(TDDFT-LRC)研究DNA分子中的碱基、碱基对的激发态。具体来说,我们将采用量子化学软件包如Gaussian、VASP等对DNA分子的结构进行模拟,并将TDDFT-LRC方法应用于计算DNA分子中碱基、碱基对的激发态,得到其波长分别对应的激发能和跃迁偶极矩等信息。
3. 研究意义
本研究的成果将有助于深入理解DNA分子的结构和电子性质,为进一步研究DNA分子在生物学上的功能提供理论基础。此外,本研究采用的TDDFT-LRC方法也可以为其他分子体系的激发态计算提供借鉴意义。
4. 研究难点
本研究所用的TDDFT-LRC方法需要处理大量的计算量和复杂的计算过程,需要利用高性能计算设备才能完成。同时,DNA分子的计算模型需要对双螺旋结构进行合理的建模和参数设置,这也是本研究的难点之一。
5. 研究目标
本研究的目标是利用TDDFT-LRC方法对DNA分子中碱基、碱基对的激发态进行计算,并得到其各波长对应的激发能和跃迁偶极矩等信息。通过对计算结果的分析和比较,深入理解DNA分子在电子性质方面的本质和特征,为更深入的研究DNA分子的生物学功能提供基础理论支持。
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