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本申请涉及生物信息学领域,具体提出了一种基于宏基因组的环境耐药组分析方法,包括:基于环境样品,获得所述环境样品的宏基因组数据;和基于所述宏基因组数据,识别功能基因,并在读长序列、重叠群序列和微生物基因组草图三个层次上分别计算所述功能基因在所述环境样品中的相对丰度;同时,本方法还包括了基于功能基因的宿主分析及侧向基因转移潜力分析。本申请提出的环境耐药组分析方法为环境耐药组研究及风险评估提供了系统性的技术解决方案。
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117174165A
(43)申请公布日2023.12.05
(21)申请号202311389711.8
(22)申请日2023.10.25
(71)申请人清华大学
地址100084
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