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mRNA差异显示筛选悬铃叶苎麻无融合生殖相关基因的基础研究的开题报告

题目：mRNA差异显示筛选悬铃叶苎麻无融合生殖相关基因的基础研究

一、研究背景和意义

悬铃叶苎麻（UrticadioicaL.）是一种广泛分布于全球的多年生草本植物，其生殖方式包括融合生殖和无融合生殖两种方式。在悬铃叶苎麻的自然群体中，两种生殖方式之间的比例存在差异，而且具有遗传性。针对这种现象，许多研究者已经开展了相关的研究，但目前对悬铃叶苎麻无融合生殖的分子机制还不完全清楚。

因此，本研究旨在通过mRNA差异显示技术筛选无融合生殖相关的基因，从分子水平上揭示悬铃叶苎麻无融合生殖的分子机制，为揭示植物无融合生殖机制提供参考和服务，同时为育种和种质资源利用提供一定的理论和实践参考价值。

二、研究内容和方法

1.实验材料：悬铃叶苎麻的两个生殖型群体（融合生殖型和无融合生殖型）。

2.RNA提取：采用RNA纯化试剂盒从悬铃叶苎麻的不同组织（根、茎、叶、花）中提取总RNA。

3.cDNA合成：使用MMLV逆转录酶将总RNA逆转录成cDNA。

4.建立文库：使用TruSeqRNA样本准备套件建立cDNA文库。

5.高通量测序：使用IlluminaHiSeqXTen进行高通量测序。

6.数据处理和分析：对测序生产的数据进行拼接和过滤，并使用CASAVA将reads比对到转录组上，并进行序列比较和表达差异分析。

7.RT-qPCR验证：通过RT-qPCR验证差异表达基因的可靠性。

三、预计研究结果

1.确定悬铃叶苎麻无融合生殖相关的基因。

2.揭示无融合生殖基因的转录水平差异和表达模式。

3.验证差异表达基因的可靠性，为研究悬铃叶苎麻无融合生殖机制提供依据。

四、研究计划

本研究预计用时18个月，具体的时间节点如下：

第一阶段（1-6个月）：样品采集与RNA提取，cDNA文库制备和高通量测序。

第二阶段（7-12个月）：数据处理和差异表达基因的筛选，RT-qPCR验证。

第三阶段（13-18个月）：对研究结果进行讨论总结，并撰写论文。

五、研究团队和预期贡献

本研究由一支由3名主要研究人员组成的团队负责，团队成员将分别担任样本采集、实验操作、数据分析和结果解释的职责。研究团队的预期贡献包括：

1.揭示悬铃叶苎麻无融合生殖的分子机制，为无融合生殖的研究提供参考。

2.筛选无融合生殖基因，为育种和种质资源利用提供实践参考价值。

3.为植物无融合生殖机制的深入研究提供一定的理论和实践基础。