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iTRAQTMT蛋白质组学分析基本知识点

蛋白质组（Proteome）一词源于蛋白质（protein）与基因组

（genome）两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。

蛋白质组与转录组有许多相似之处，也具有时空特异性，会随着环境、组织或个体的改变而改变。

蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生、细胞代谢、生长发育以及各种胁迫反应等过程的整体而全面的认识。

iTRAQ和TMT的结构与区别

iTRAQ和TMT是近年来应用最广泛的差异蛋白质组学技术，它们均采用体外标记的方法，利用同位素试剂标记蛋白质酶解后产生的多肽，对两个或多个样本，在全蛋白质组层面上展开相对定量分析。

说到这里,很多人可能会认为iTRAQ和TMT是两种不同的定量技术，其实二者只是不同厂家生产的（iTRAQ是ABSCIEX研发，TMT是ThermoFisher研发），在标记规格（iTRAQ是4标和8标的；

TMT是2标、6标以及10标的）、标签分子结构上有些许差异，其他原理基本一样。

QuestionsandAnswers

1、iTRAQ/TMT与Labelfree相比有什么优势