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基于EF-1a序列的盾蚧亚科7属的分子系统学研究的开题报告
1.研究背景和意义:
盾蚧亚科(Coccoidea:Diaspididae)是植食性昆虫中重要的群体之一,包括了全球分布的1350多种,对于农林业害虫防治具有重要的作用。分子生物学技术的发展为盾蚧亚科的分类研究提供了新的手段,然而至今盾蚧亚科内差异大、分类复杂的问题仍未解决,需要通过分子系统学方法深入研究优势种的基因组和亚科间的差异,掌握盾蚧亚科的多样性和系统演化情况。
2.研究目的:
本研究旨在通过分子系统学方法对盾蚧亚科中7个属的基于EF-1a序列的分子系统学研究进行探讨,解决其分类复杂的问题,为盾蚧科的分类、演化以及害虫防治提供科学有效的理论基础。
3.研究内容:
(1)样本收集:收集盾蚧亚科中7个属的标本,进行标本照相和记录相关信息。
(2)DNA提取:利用基于CTAB法的DNA提取技术从盾蚧亚科标本中提取总DNA。
(3)PCR扩增:利用特异性引物对EF-1a序列进行PCR扩增,并进行电泳纯化。
(4)测序和序列编辑:将PCR产物进行测序,然后对测到的序列进行编辑、校正等处理。
(5)系统发育重建:基于EF-1a序列进行系统发育分析,并利用MEGA软件对系统进化树进行构建、Bootstrap支持率和仙人掌图的绘制。
4.可行性分析:
(1)本研究的EF-1a序列选择合理,已广泛应用于昆虫分子系统学研究中。
(2)收集的标本数量足够,涵盖了盾蚧亚科中7个较为典型的属,具有代表性。
(3)提取DNA技术已经成熟,PCR扩增、测序等步骤均属标准操作。
(4)MEGA软件在系统发育树构建和支持率估算方面具有高效、准确性和易于解释等优点。
5.研究预期成果:
(1)获取盾蚧亚科7属EF-1a序列信息,对其分类、演化关系及多样性进行深入研究;
(2)建立盾蚧亚科的系统发育树及支持率估算;
(3)明确优势种的基因组与亚科间的差异,为盾蚧亚科的分类、演化及害虫防治提供理论依据。
6.研究进度安排:
(1)第一年:收集盾蚧亚科7个属的标本,进行DNA提取、PCR扩增及测序工作。
(2)第二年:对所得到的EF-1a序列进行编辑、处理及系统发育重建。
(3)第三年:分析系统进化树并进行进化关系的解释和阐述,撰写毕业论文。
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