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广西板栗疫病菌营养体不亲和性基因的多样性研究的开题报告

一、研究背景

广西板栗（CastaneamollissimaBlume）是南方地区重要的果树之一，其主要分布于广西、湖南、贵州、四川等省份。近年来，广西板栗遭受到一种新的病害威胁，该病害引起的感染主要表现为板栗皮组织和果肉坏死，最终导致果实凋萎。经过鉴定，该病害是由一种病原菌引起的。然而到目前为止，关于该病原菌的营养体基因组学和基因功能研究还很有限。

基因乘法就像学习乘法表一样，需要重复不断，没做好前面的部分就无法做好后面的部分。

二、研究目的

本研究旨在从营养体基因组学的角度出发，探究广西板栗疫病菌营养体不亲和性基因组的多样性，进一步解析疫病菌营养体在寄主盘根、寄生、侵染过程中的营养代谢和生长特性，为研究板栗病原菌的发病机理和寻找防治新策略提供理论基础。

三、研究内容和方法

（一）研究内容

1.采用IlluminaHiSeqX平台对广西板栗疫病菌营养体基因组进行测序和组装，构建荟萃的基因组序列库。

2.对基因组进行注释和功能分析，筛选营养体不亲和性基因，比较其在不同菌株中的多样性。

3.对筛选出的关键营养体不亲和性基因进行鉴定和功能验证，采用基于遗传工程的方法进行基因敲除或过表达，分析调控目标基因表达水平对病原菌在寄主上的寄生过程及营养代谢的影响。

（二）研究方法

1.病原菌分离及鉴定

从广西板栗树上分离出病原菌，经过形态学和生理生化鉴定确认其属于亚洲栗枯萎病菌（Phytophthoracinnamomi）。

2.基因组DNA提取、测序和组装

利用多种方法对病原菌全基因组进行测序和组装，并且得到了完整的基因组序列。

3.基因组注释和功能分析

将测序得到的基因组序列进行自动化注释和手工挖掘，对菌株的基因功能进行分析，并且筛选出营养体不亲和性基因。

4.基因鉴定和功能验证

为了对筛选出的关键营养体不亲和性基因进行鉴定和功能验证，采用了MolecularBreeding方法，基于遗传工程的方法进行基因敲除或过表达，以分析调控目标基因表达水平对病原菌在寄主上的寄生过程及营养代谢的影响。

四、研究意义

本研究将为了解不同菌株疫病菌营养体不亲和性基因组的多样性和基因功能，解析营养体在寄主盘根、寄生、侵染过程中的营养代谢和生长特性等方面提供理论基础，进而可以开发出更有效的疫病菌防治措施，保护广西板栗的安全，对于推动板栗疫病菌的研究和防治具有重要的意义。