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基于免疫信息学技术的雏沙门菌多表位疫苗构建
摘要:【目的】设计针对雏沙门菌(SalmonellaPullorum)IpaJ蛋白的多表位疫苗(multi-epitopevaccine,MEV),
为净化鸡白痫提供新的疫苗。【方法】选用IEDB预测维沙门菌IpaJ蛋白的T淋巴细胞主要组织相容性复合体I
(MHCI)类分子结合表位;用NetMHCIIpan4.OServer预测T淋巴细胞MHCIⅡ类分子结合表位;用IEDB预测
B淋巴细胞表位。将各个服务器预测结果筛选出的表位经过VaxiJenv2.0评估抗原性后,将合格的表位通过柔性
linker串联成多表位疫苗。对构建的多表位疫苗进行抗原性、理化性质、N-糖基化位点、二级结构和三级结构预测。
使用分子对接评估多表位疫苗与免疫受体的结合能力,使用免疫模拟评估多表位疫苗的免疫效果,最后优化密码
子便于克隆表达。【结果】经筛选后,选择4个MHCI、4个MHCII和8个B淋巴细胞表位优势表位构建的多表
位疫苗MEV-IpaJ。多表位疫苗MEV-IpaJ的分子质量为28.18ku,为稳定亲水蛋白,具有良好的抗原性,存在4个
潜在的N-糖基化位点,α-螺旋、延长链、β-
构Ramachandran作图显示,优势区域中含有残基数占89.9%%,进行细化后优势区域的残基数增加到94.0%,三
级结构突出表位作图也证明MEV-IpaJ具有良好的免疫原性。分子对接结果显示,MEV-IpaJ与Toll样受体2
(Toll-likereceptor2,TLR2)和TLR4蛋白分子可对接。免疫模拟结果显示,MEV-IpaJ具有较好的免疫应答,能提
高部分细胞因子的表达,经密码子优化确保设计的MEV-IpaJ可在大肠杆菌K12表达系统中高效、稳定地表达。
【结论】本研究构建的多表位疫苗MEV-IpaJ可有效表达并可能诱导强烈的T细胞和B细胞免疫应答。本研究为
维沙门菌多表位疫苗的设计提供了一种新的方法,为雏沙门菌多表位疫苗的研发提供了理论依据及数据支持。
关键词:雏沙门菌;免疫信息学;表位;多表位疫苗
ConstructionofaMulti-epitopeVaccineAgainstSalmonella
PullorumbyImmunoinformaticsApproach
Abstract:[Objective]Thisstudywasaimedtodesignmulti-epitopevaccineagainstIpaJproteinof
SalmonellaPullorumandprovideanewvaccineforpurifyingchickendysentery.[MethodJInthis
study,IEDBwasusedtopredictthemajorhistocompatibilitycomplexclassI(MHCI)
molecularbindingepitopesofSalmonellaPullorumIpaJproteininTlymphocytes.NetMHCIIpan
4.OServerwasusedtopredictTlymphocytesMHCIImolecularbindingepitopes.Blymphocyte
epitopewaspredictedbyIEDB.Aftertheantigenicityoftheselectedepitopeswasevaluatedby
VaxiJenv2.O,thequalifiedepitopeswereconcatenatedintomulti-epitopevaccinebyflexible
linker.Antigenicity,physicochemicalproperties,N-glycosylationsites,secondarystructureand
修回日期:2023-06-07
1期谭菊等:基于免疫信息学技术的雏沙门菌多表位疫苗构建
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