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引导编辑系统研究进展
摘要:引导编辑(Prime
editing,PE)系统是一种全新的、革命性的基因组编辑策略。该系统由引导编辑器(Prime
editor)组成,包括nCas9(H840A)与逆转录酶(Reverse
transcriptase,RT)的融合蛋白;以及包含PBS(Primer
binding
site)序列和RT模板(RT
template,RTT)序列的pegRNA(Prime
editing
guide
RNA)两大部分。PE系统
可以在双链不断裂的情况下实现所有12种类型的碱基替换及小片段DNA增删,是精准编辑的全新范式。自
2019年开发至今不到4年时间,PE系统作为一种通用的技术平台,已广泛应用于医疗、农业等各个领域,产生
了一大批新种质资源、基因治疗药物等优秀应用案例。PE作为目前最灵活、最具发展前景的基因组精准编辑新
手段,仍旧存在效率偏低、大片段操纵能力不足、系统组分设计复杂(如pegRNA)、安全性未全面评估等问题,仍
需要深入研究。本文详细介绍了PE系统的技术原理及限制因素,全面总结了PE系统自开发以来的优化策略及
在动植物系统、医疗领域的应用现状,并对PE的发展前景进行了展望。
关键词:引导编辑系统;优化策略;农业应用;医疗应用
Recentadvancesinprimeeditingsystem
Abstract:Prime
editing
(PE)
system
is
a
newly
developed
and
greatly
revolutionized
genome
editing
technology.
The
system
is
based
on
prime
editors,
which
are
composed
of
two
components:
A
fusion
protein
of
nCas9
(H840A)
and
reverse
transcriptase
(RT),
and
a
pegRNA
which
contains
a
PBS
(Primer
binding
site)
sequence
and
an
RT
template
(RTT)
sequence.
The
PE
system
can
realize
all
12
types
of
base
substitutions
and
small
fragment
DNA
additions
and
deletions
without
double-strand
breaks,
which
is
a
new
paradigm
for
precision
editing.
In
less
than
4
years
since
its
development
in
2019,
the
PE
system,
as
a
universal
technology
platform,
has
been
widely
used
in
various
fields
such
as
healthcare
and
agriculture,
generating
a
large
number
of
excellent
application
cases
such
as
new
germplasm
resources
and
gene
therapy
drugs.
PE,
as
the
most
flexible
and
promising
new
means
of
precision
genome
editing,
still
suffers
from
low
efficiency,
insufficient
ability
to
manipulate
large
fragments,
complex
design
of
system
components
(such
as
pegRNAs),
incomp
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