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应用21个微卫星座位对广西巴马小型猪五个近交系群体的遗传学分析的任务书
任务名称:应用21个微卫星座位对广西巴马小型猪五个近交系群体的遗传学分析
任务描述:
广西巴马小型猪是中国南方地区一种优秀的猪种,由于近交程度高,遗传多样性低等因素,其生产性能逐渐下降,需要通过遗传学分析了解其遗传特点,为选育改良提供科学依据。本任务旨在应用21个微卫星座位对广西巴马小型猪五个近交系群体的遗传学分析。
任务内容:
1.收集广西巴马小型猪五个近交系群体的样本,提取DNA并进行质量检测;
2.根据已有文献和数据,筛选出适合巴马小型猪的21个微卫星座位,并进行引物设计和合成;
3.序列扩增:采用PCR方法进行微卫星标记的扩增,PCR扩增反应体系为20μl,PCR条件也需要优化;
4.PCR产物检测:采用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR反应产物进行检测,筛选出阳性样品;
5.电泳分型和数据处理:将阳性样品进行电泳分型,并对得到的数据进行处理,包括测定等位基因频率、观察杂合度等;
6.建立群体系谱:通过建立群体系谱,分析各个近交系群体之间的亲缘性;
7.通过统计学方法进行遗传多样性分析:如遗传距离分析等;
8.通过对遗传学分析数据的比较和分析,从遗传层次更好地解释广西巴马小型猪生产性能的差异及其遗传变异的原因。
任务成果:
1.样品的基因组DNA提取及质量检验报告;
2.应用21个微卫星座位进行广西巴马小型猪五个近交系群体的遗传学分析的原始数据;
3.经过数据处理和统计分析的广西巴马小型猪五个近交系群体的遗传学分析报告;
4.针对广西巴马小型猪五个近交系群体的遗传学分析和比较分析,提出改良选育的遗传策略建议。
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