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大肠杆菌功能启动子筛
选过程
集团企业公司编码:(LL3698-KKI1269-TM2483-LUI12689-ITT289-
大肠杆菌功能启动子筛选过程
强启动子对于基因工程操作中外源基因的表达效率有显着的影响,
因此他的筛选具有重要的意义。
大肠杆菌的启动子位于-10区和-35区,常见的原核生物在启动子上
虽然没有较大差别,但是为了能高效表达,还是应从大肠杆菌自身的基
因组中选择强启动子,因为这也和外源启动子稳定性和大肠杆菌RNA聚
合酶结合的倾向性有感(优先结合与自身);另外还要考虑载体的拷贝
数,多拷贝载体和单拷贝在形成产物的量上是有差别的,当然,如果能
够通过载体把外源基因整合到宿主(这里指大肠)上,这样就能防止在
传代是质粒不稳定或丢失的现象。
筛选步骤:
(1)大肠杆菌基因的分离:去垢剂溶解细胞,酚和蛋白酶去除蛋白质,
核糖核酸酶去除RNA,乙醇沉淀等步骤,得到大肠杆菌基因组、
(2)DNA分子的切割:用限制性核酸内切酶进行切割;限制酶产生的黏
性末端、末端转移酶合成的同聚物接尾以及合成的人工接头等。酶切后
的片段中就含有想要得到的启动子片段,片段进行PCR扩增。
(3)载体选择:能在大肠杆菌中自主复制,对某些限制酶来说只有一个
切口,并在酶作用后不影响其自主繁殖能力。从细菌核酸中易于分离和
纯化。在宿主中能以多拷贝形式存在,有利于插入的外源基因表达,能
在宿主中稳定地遗传。进入宿主细胞的载体主要有:a质粒:重组DNA以
转化的方式进入宿主细胞;bλ噬菌体:重组DNA以转染的方式进入宿主
细胞;c柯斯质粒:以转导的方式进入宿主细胞。我们这里选择以来自大
肠杆菌的含有氨苄青霉素抗性基因的不含启动子的PBR322质粒作为载体
(常用的质粒载体,能在基因公司很容易买到因为题目要求要以氨苄青
霉素抗性基因作为报告基因)。酶切质粒(选与2中一样的酶来切,这
样就能得到相同的粘性末端,容易将质粒与DNA片段结合),PCR扩增至
一定量。
(4)质粒片段与DNA片段结合,导入受体细胞(这里是大肠)。
(5)将得到的大肠杆菌在液体培养基中进行培养。
(6)制作青霉素梯度平板或者是添加有青霉素的梯度LB液体培养基。
(7)将5中得到的菌体稀释为菌悬液,在6中涂布培养或液体发酵培
养。
(8)含有强启动子菌体的检出。因为能在青霉素中生长大肠是经过了质
粒导入后的氨苄青霉素抗性基因的表达引起的(当然,也有一些是野生
型大肠杆菌发生了突变,所以在选择报告基因时我们更应倾向于选择双
报告基因作为标记),而他的表达则证明了启动子的存在。(大多数情
况下,在高浓度青霉素环境中生长的都是成功导入质粒载体的菌体,且
能在越高浓度青霉素环境生长的为能高效表达的,即含有强启动子的基
因)
(9)将8中检出的菌体在一定量青霉素培养中培养,扩大培养,淘汰不
能稳定遗传的菌体,破壁,收集质粒。收集到的质粒继续以同一种酶切
割。
(10)切割后得到的片段以探针(大肠杆菌-30区和-10区启动子为CAAT
和TATA,探针就是由他们的互补链在固定相上做成,可以买的)吸附,
富集,得到大肠杆菌的强启动子。
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