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  • 2024-03-17 发布于山西
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Str2Str:基于分数模型的zero-shot蛋白质构象采样方法.pdf

Str2Str:基于分数模型的zero-shot蛋白质构象采样方法

——简介——

如何高效采样蛋白质尤其是天然无规蛋白质(IDP)的多种结构一直是计算结构生物学领域的一大难点。

通常,此类问题是通过分子模拟(包括MC采样和MD采样)来解决,同时配合各种增强采样算法提高效

率。近年来,得益于GPU算力的进步,各种基于深度学习的增强采样和构象生成算法被提出,但大都需

要针对某一体系预先的MD轨迹数据,没有办法直接从序列生成具有多样性的构象。2024年1月,来自蒙

特利尔大学Mila研究院JianTang课题组的JiaruiLu等人开发了基于分数模型蛋白质zero-shot构象采样模

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