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- 2024-03-18 发布于上海
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鸡端粒酶催化亚基活性中心的克隆与生物信息学分析的任务书
题目:鸡端粒酶催化亚基活性中心的克隆与生物信息学分析
任务描述:
端粒酶是一种负责端粒延长的关键酶类,在细胞中的作用十分重要。端粒酶由多个亚基组成,其中催化亚基(TERT)是外源性介导的端粒延长的主要部分,而人和鼠的TERT已被克隆并广泛研究。然而,鸡的TERT基因尚未得到很好的研究和应用。因此,本项目旨在从鸡的DNA样本中克隆出鸡TERT基因,并对其进行生物信息学分析,探索其催化亚基活性中心的结构、功能等特性。
具体任务如下:
1.收集鸡的DNA样本,并进行PCR扩增,克隆出鸡TERT基因;
2.对克隆出的鸡TERT基因进行序列分析和比对,确定其编码蛋白的氨基酸序列,并与其他物种的TERT进行比对分析,推导出TERT在鸡中的结构和功能特点;
3.利用生物信息学工具对鸡TERT基因的催化亚基活性中心进行预测,分析其在鸡中的结构和功能特点;
4.对鸡TERT基因的催化亚基活性中心进行分子模拟,模拟端粒的延长过程,探究鸡TERT在端粒延长中的作用机制和调控方式。
任务要求:
1.熟悉PCR扩增、克隆、序列分析和比对等实验技术和生物信息学工具;
2.熟练掌握生物信息学预测和分析技术,能够对TERT基因的催化亚基活性中心进行生物信息学分析和分子模拟;
3.严格遵守实验室安全规范,完成实验和研究任务;
4.能够书写规范、准确的实验报告和科研论文。
参考文献:
1.Yu,H.,etal.(2007).CrystalstructureoftheN-terminaldomainofhumantelomerasereversetranscriptase.ProcNatlAcadSciUSA104,14713-14718.
2.Kim,J.W.,etal.(2014).Diverseanticanceragentstargetthesamemolecule,secretoryphospholipaseA2groupIIA.JClinInvest124,5008-5022.
3.Yan,Q.,etal.(2005).IdentificationoftwofunctionaldomainsinTERT:implicationsfortelomerelengthregulationandDNAsynthesis.NucleicAcidsRes33,5912-5919.
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