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一种纳米孔测序中条形码的设计方法.pdfVIP

一种纳米孔测序中条形码的设计方法.pdf

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    本发明公开了一种纳米孔测序中条形码的设计方法，属于分子生物学技术领域。本发明利用碱基A、G、C、T形成一定长度的序列作为候选序列，对该候选序列进行预处理，初步筛选有差异性的序列；设定阈值t，保证设计出的条形码集合中任意两个序列之间有足够大的差异性；针对最远点采样算法进行改进；在确定阈值t和候选的条形码集合之后，采用改进的最远点采样算法来挑选条形码，输出采样集合。本发明利用改进的最远点采样算法设计条形码套件，极大程度上保证了设计条形码之间的差异性，并且实现了较高的解复用精度。本发明解决了纳米孔测序

    (19)国家知识产权局

    (12)发明专利申请

    (10)申请公布号CN117727367A

    (43)申请公布日2024.03.19

    (21)申请号202410028775.3

    (22)申请日2024.01.09

    (71)申请人山东大学

    地址266200

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