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鸡柔嫩艾美耳球虫表达序列标签和不同发育阶段基因表达谱分析的任务书

任务目的：利用高通量测序技术，对鸡柔嫩艾美耳球虫表达序列标签和不同发育阶段基因表达谱进行分析，探究其基因表达模式及功能。

任务内容：

1.样品准备：采集鸡柔嫩艾美耳球虫不同发育阶段的样品，并提取RNA。

2.序列标签生成：利用IlluminaHiSeq平台，根据下机序列数据质控，对样品进行序列标签的生成。

3.序列注释和分析：对生成的序列标签进行BLAST分析、GO分析和KEGG通路分析等，确定基因注释及相关功能分析。

4.基因表达谱分析：利用不同软件对生成的序列定量数据进行分析，比较不同样品之间差异的基因。

5.结果解读和报告撰写：对分析结果进行解读，并撰写分析报告。

任务步骤：

1.根据样品来源和处理方法，设计实验方案并采集样品。

2.RNA提取及RNA质量检测、库制备并测序。

3.对测序数据进行质控、去除含有适量N的序列、去除低质量序列后，进行序列聚类、重做和序列长度的拆分。

4.进行序列注释和分析，确定基因注释和相关功能分析。

5.基于测序数据，进行基因表达谱分析，比较不同样品之间差异的基因。

6.根据分析结果解读撰写分析报告。

任务结果：

1.确定鸡柔嫩艾美耳球虫的基因表达模式和功能，为深入理解其发育和代谢机制提供基础资料。

2.推广高通量测序技术在宏基因组学中的应用。

3.研究成果对鸡柔嫩艾美耳球虫的研究和防治具有重要意义。