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蛋白质功能位点及相互作用位点预测的任务书
任务描述:
蛋白质是生命体系中重要的基本分子,其功能主要由蛋白质分子内部的功能位点及与其他分子的相互作用位点所决定。因此,预测蛋白质分子的功能位点及相互作用位点是蛋白质学领域的热门问题之一。本任务的目的是掌握蛋白质功能位点及相互作用位点预测的基本方法与技术。
任务要求:
1.了解蛋白质功能位点及相互作用位点的定义和功能。
2.掌握预测蛋白质功能位点和相互作用位点的基本方法和流程。
3.了解蛋白质序列和结构的特点及其在功能位点和相互作用位点预测中的作用。
4.熟悉常用的功能位点和相互作用位点预测软件和数据库的使用。
5.通过实践,掌握预测蛋白质功能位点和相互作用位点的实践技巧,能够对蛋白质进行功能分析。
6.能够撰写相关领域的报告或论文,并能够通过讨论、汇报等方式,表达自己的见解和思考。
参考资料:
1.DengH,XiaS,HuangDS.Predictingproteinfunctionandinteractionfrombiomedicaltextsusingjointsentenceextractionandinference.BMCbioinformatics.2018Jun22;19(Suppl8):262.
2.ZareieZ,SadeghiM.PredictionofDNA-bindingproteinsandbindingresiduesbycombiningdifferentfeatures.InterdisciplinarySciences:ComputationalLifeSciences.2018Jun1;10(2):258-69.
3.LaiCH,HuangYM,LuWC,ChenPY,TsaiCF,HuangCY,etal.Insightsintoprotein–proteinbindingbybindingfreeenergycalculationandfreeenergydecompositionfortheprotein–proteindockingproblem.PhysicalChemistryChemicalPhysics.2017;19(18):11290-301.
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