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本发明公开了一种基于多源异构图学习的蛋白质相互作用预测方法,包括:S1、根据氨基酸的理化性质,利用自协方差对蛋白质序列特征进行提取;S2、构建多源关联网络;S3、获得蛋白质与其他生物分子的关联信息特征;S4、获取已知的蛋白质‑蛋白质相互作用对作为正样本数据集,随机取样等量的无关联蛋白质‑蛋白质相互作用对作为负样本数据集,将正负样本数据集合并作为最终的数据集;S5、利用随机森林分类器和相应的最优参数进行训练以构建预测模型;S6、采用五折交叉验证的方法得到模型的性能评价指标。本发明可以更充分地利用残
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117831663A
(43)申请公布日2024.04.05
(21)申请号202410010541.6G16B40/00(2019.01)
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