扩增子测序-宏基因组测序.pdf

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2023/5/113:53扩增子测序/宏基因组测序基因组/代谢组学威斯腾生物——16年专注模式动物/原代培养/基因编辑！！

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扩增子测序/宏基因组测序

原代细胞培养

CRISPR/Cas9细胞敲除/入时间：2020-07-1717:26:00浏览：2397次

扩增子测序

模式与转基因动物扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。

16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目的区域，通过检测目的区域的序

研究环境微生物多样性及群落组成差异。

动物医学实验

16S/18SrDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间

28S之间。

蛋白质组学扩增子测序的优势：

采用目前IlluminaHiSeq最长测序平台，可以满足16S1~2个高变区的测序分析。3天内同时完成3,000个16S样本的测序，测序准确

高10%，而拼接效率较MiSeq平台提高25%，以此获得更全面的菌群信息。

基因组/代谢组学扩增子测序操作步骤：

1、研究对象的选取；

2、提取基因组DNA，DNA浓度需要达到5ng/ul,总量需要大于等于150ng;

分子生物学检测3、构建PCR-free文库；

4、PE250测序;

5、信息分析分析内容=标准分析+高级分析，基于目的区域的测序，检测序列丰度，以充分研究环境微生物多样性和群落

细胞生物学检测服务周期：

45天左右

基因/蛋白芯片宏基因组测序

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