生物信息学概述省公开课一等奖全国示范课微课金奖课件.pptx

第一章生物信息学概述;;1.什么是生物信息学;生物信息;DNA-遗传密码携带者;引自NeilCampbell著Biology第4版，1996;从基因组序列信息到基因功效;8;9;10;2.Why?;;;;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;;human;27/79;1,000

1,000,000

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1,000,000,000,000,000,000,000,000;至2004年，国际数据库统计核酸碱基数目已超出200亿！假如用传统纸张来书写，以每个核苷酸作为一个字符，则需要印制2万本每本1000页每页1000字书！

另外，二维凝胶电泳技术、测序质谱技术以及生物芯片技术高速发展和广泛应用，也使得大量数据信息已经无法用传统文件形式发表，而更多需以数据库形式，经过文字、图象、超链接等各种方式来统计。;30;31;32;第二节生物信息学研究领域;

（一）、核酸及基因组信息

1、大规模核酸测序及拼接

2、基因识别与定位

3、基因相关SNP研究

4、非编码区信息结构分析

5、比较基因组学;35;36;37;2、基因识别与定位;3.基因相关SNP研究;40;4、非编码区信息结构分析;5、比较基因组学;;44;蛋白质组研究;(三)、分子相互作用及代谢调控网络;47/79;48;(四)、生物进化研究;生物信息数据库

数据库接口和检索工具研制

新算法和软件

1、多序列比较方法

2、序列拼接与分析

3、基因组大尺度作图和功效基因组分析方法

4、蛋白质结构和功效预测

5、生物大分子结构图形化显示

6、细胞代谢过程模拟

7、药品设计相关软件开发;第三节在药学领域应用;1、诊疗类药品：生物芯片设计

遗传病：基因诊疗

感染性疾病：抗体、基因芯片、PCR技术;53;;EPIMMUNE

IMGT/HLADatabasehttp://www.ebi.ac.uk/imgt/hla

HLASequenceDatabase.uk/HIG

EpiMatrix/Research/TB-HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html

EPIPREDICThttp://www.epipredict.de

;http://www.jenner.ac.uk/MHCPred/;所谓基因组药品(Genomicdrug)是指利用基因序列数据，经生物信息学分析、高经过基因表示、高通量功效筛选和体内外药效研究开发得到新药候选物．

实际上利用了反向生物学原理．沿着从基因序列一蛋白质一功效一药品路径研制新药，其优势是取自???大人类基因资源及其编码蛋白质做为原材料，含有巨大开发潜力。

;58;人类基因组约有10万左右基因．编码10万以上蛋白质，其中最少5％即5000以上基因编码蛋白质可能含有药品开发前景．而当前利用常规技术开发人类重组蛋白质药品已上市只有20各种，进入临床试验只有100各种。;美国人类基因组科学企业(HGS企业)。依据其1999年2月公布消息，在功效基因组研究领域，HGS企业己发觉95％人类cDNA；克隆了9000个人类分泌蛋白质全长cDNA；发觉了3000个基因可能医学应用；发觉了35个新白细胞介素类分子和40个新生长因子类分子；已经有3个基因组药品进入临床。;4、寻找药品作用新靶点;理想抗生素靶标应为微生物细胞存活所必须，在病原体中高度保守，且在人体中不存在或与人类基因有根本差异。

;63;计算机辅助分子建模，分子三维结构可视化。

1982年，Dock程序

已成功有HIV蛋白酶抑制剂、二氢叶酸还原酶抑制剂等;试验发觉2-去氧-2,3-双去氢-D-N-乙酰神经氨酸（Neu5Ac2en）对唾液酸酶有抑制作用，但在动物模型中效果不佳。;;;68/79;;（三）、开发阶段：药品基因组学

降低药品副作用

防止开发风险

;;;73;74;75;76;;学习方法;79