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回诵渕回

大豆科学SoybeanScience2019,38(2):212-216

http：//www.haasep.cnDOI：10.11861/j.issn.1000-9841.2019.02.0212

基于MLM混合线性模型的大豆全基因组关联分析可行性研究

唐友-王永江，张继成S许薇

(1.吉林农业科技学院电气与信息工程学院.吉林吉林132101；2.东北农业大学电气与信息学院，黑龙江哈尔滨150030)

摘要:为研究MLM混合线性模型在大豆全基因组关联分析中应用的可行性，以便精确寻找影响表型性状差异的主

要基因标记位点范围，帮助检测分析个体在全基因组水平范围内遗传变异的多态性，采用混合线性模型，引入固定效

应和随机效应来分解和计算基因组与多性状之间的相关性,对大豆全基因组数据与对应的表型性状进行关联分析。

根据模型计算结果得出P值并展示有效基因位点图,不同性状与对应有效基因标记关联性显著突出。通过设定的模

拟有效基因位点检验混合线性模型关联分析的遗传评估力，结果高出一般线形模型的效率，验证该方法在大豆全基

因组关联分析上具有可行性，可为其它物种进行关联分析研究提供借鉴。

关键词：混合线性模型;大豆;基因组;关联分析;遗传评估力

FeasibilityStudyofSoybeanGenomeWideAssociationStudyBasedonMixed

LinearModel

TANGYou1,WANGYong-jiang1,ZHANGJi-cheng2,XUWei

(1.ElectricalandInformationEngineeringCollege,JiLinAgriculturalScienceandTechnologyUniversity,Jilin132101,China；2.CollegeofElectricaland

Information,NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150030,China；)

Abstract:TostudythefeasibilityofMixedLinearModel(MLM)onsoybeangenomewideassociationstudy,inordertoacc

ratelyidentifythemaingenemarkerlocithataffectphenotypictraitsbycorrelationanalysisbetweensoybeangenome-widedata

andthecorrespondingphenotypictraits,thisstudydetectedandanalyzedthe|M)lyinorphismofindividualgeneticvariationat

thegenome-widelevel.Themainanalysismethodwastodecomposeandcalculategenotypedata.Theeffectsweredividedinto

twoparts：Fixedandrandom.Thestatisticalcorrelationofmixedlinearmodelsisintroduced.Accordingtothecalculatedre­

sultsofthemodel,thePvalueandthedisplaycontrastfigurecanbeusedtofindtheeffectivegenelociintuitively,andthe

significantrelationshipbetweendifferenttraitsandgenemarkerscanbeanalyzedintuitively.Thegeneticevaluationpowerof

hybridline