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云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的全长cDNA克隆与序列分析的开题报告
摘要
云南萝芙木(DenisophyllumyunnanenseChengetLaw)是一种具有重要经济价值和药用价值的常绿乔木。该植物的异胡豆苷(isoflavone)含量较高,具有良好的生理活性和药用价值。本研究旨在克隆云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的全长cDNA,并对其进行序列分析,为进一步研究其功能提供基础。
首先,利用RT-PCR技术从云南萝芙木中克隆出异胡豆苷合成酶基因的片段,并将其进行测序,确定了基因的部分序列。随后,基于已经获得的片段序列,使用RACE技术扩增了异胡豆苷合成酶基因的全长cDNA序列,并进行了测序和序列分析。结果显示,该基因全长为1,865bp,包含一个1,575bp的开放阅读框(ORF),编码525个氨基酸。
基于序列比对分析,该基因的氨基酸序列与豌豆和大豆中的异胡豆苷合成酶具有较高的同源性。进一步分析表明,云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因中包含两个保守结构域,分别为磷酸二酯酶和C-端结构域,这些结构域与异胡豆苷合成酶催化反应和互相作用息息相关,说明该基因与豌豆和大豆中的异胡豆苷合成酶在结构和功能上具有一定的相似性。
本研究成功克隆了云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的全长cDNA,并对其进行了序列分析。该结果为进一步研究该基因的功能提供了基础和参考。同时,该研究对于了解云南萝芙木异胡豆苷生物合成途径也具有重要的意义。
关键词:云南萝芙木;异胡豆苷合成酶基因;全长cDNA;序列分析。
Abstract
DenisophyllumyunnanenseChengetLawisanevergreentreewithimportanteconomicandmedicinalvalues.Theisoflavonecontentofthisplantishigh,andithasgoodphysiologicalactivityandmedicinalvalue.Theaimofthisstudyistoclonethefull-lengthcDNAoftheisoflavonesynthasegenefromD.yunnanenseandanalyzeitssequence,providingabasisforfurtherstudyingitsfunction.
Firstly,afragmentoftheisoflavonesynthasegenewasclonedfromD.yunnanenseusingRT-PCR,anditssequencewasdetermined.Then,thefull-lengthcDNAsequenceoftheisoflavonesynthasegenewasamplifiedusingRACEtechnologybasedontheobtainedfragmentsequence,anditssequencewasanalyzed.Theresultsshowedthatthefulllengthofthisgeneis1,865bp,containinganopenreadingframeof1,575bp,whichencodes525aminoacids.
Sequencealignmentanalysisshowedthattheaminoacidsequenceofthisgenehashighhomologywiththeisoflavonesynthaseinpeasandsoybeans.FurtheranalysisshowedthattherearetwoconserveddomainsintheisoflavonesynthasegeneofD.yunnanense,includingaphosphodiesterasedomainandaC-terminaldomain,whicharecloselyrelatedtothecatalyticreactionandinteractionoftheisoflavonesynthase,indicatingthatthisgeneisstructurallyandfunctionallysimilartotheisoflavone
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