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生命科学学院原核微生物分类系统纲要
原核微生物分类系统纲要原核生物包括古生菌和细菌两个域。其分类工作是一件意义重大而又艰巨的工作。《伯杰氏鉴定细菌学手册》（简称《伯杰氏手册》）是原核生物分类的权威经典之作，从1923年第一版至今已出版了11个版本。1~9版：1923、1925、1930、1934、1939、1948、1957、19741989《伯杰氏系统细菌学手册》（第一版）2001~2012《伯杰氏系统细菌学手册》（第二版）美国宾夕法尼亚大学细菌学教授伯杰（D.Bergey1860-1937）
原核微生物分类系统纲要《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)（20世纪80年代末期，国际上20余国家的300位专家合作编写了4卷本的新手册）第一版、第二版
原核微生物分类系统纲要（1）内容丰富、5卷2域(古生菌域和细菌域）。（2）分类特点：表型、实用性鉴定指标为主的旧体系向鉴定遗传型的系统进化分类体系转变；使分类系统与真正反映亲缘关系的自然体系日趋接近。《伯杰氏系统细菌学手册》1984-1989（4卷）第一版；《伯杰氏系统细菌学手册》2001-2007第二版（5卷），更多地依靠系统发育资料对细菌分类，而不仅仅是依据表性特征。
原核微生物分类系统纲要该工具书收录了古菌域和细菌域中的24个门，其中古菌域和细菌域中的23个门分别发表于“伯杰氏手册”第1~4卷中，另1个门，即放线菌门(Actinobacteria)，发表于第5卷中，分为A、B两册。《伯杰氏手册》提要，见教材p.336-342三域学说（ThreeDomainsTheory）1977年C.R.Woese提出三域学说：（真）细菌域、古细菌域和真核生物域。依据：生物的16S和18SrRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平，而提出各个界级分类新系统。
三域学说简介C.R.Woese三域学说（ThreeDomainsTheory）1977年C.R.Woese提出并逐步完善的三域学说：细菌域、古生菌域和真核生物域依据：生物的16S和18SrRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平，而提出各个界级分类新系统。
三域学说简介
三域学说简介16SrRNA系统发育树
三域学说简介三域学说遇到的挑战：自提出了质疑，主要认为16S或18SrRNA的分子进化很难代表整个基因组的分子进化；其次是已知有许多真核生物的基因组和它们表达的功能蛋白更接近于细菌而并非接近于古生菌等。无论那一个分类系统，并不是完美的，需要后来分类学家的不断修订和完善，使其更趋于自然和科学。
小结《伯杰氏鉴定细菌学手册》：简称《伯杰氏手册》，1~9版：1923、1925、1930、1934、1939、1948、1957、1974、1994，每个版本都反映了当时细菌学发展的新成就伯杰氏系统细菌学手册121984~1989，国际上20余国的300位专家合作编写了4卷新手册，书名《伯杰氏系统细菌学手册》（简称《伯杰氏手册》）（第一版）2001~2012《伯杰氏手册》（第二版）共5卷，为最新分类体系
谢谢大家！
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