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本发明公开了一种基于自注意力编码和池化机制的毒力因子识别方法及系统，该方法首先利用蛋白质预训练语言模型ESM‑2提取毒力因子的氨基酸序列初始特征，利用自注意力编码器对毒力因子的氨基酸序列初始特征进行编码，通过一个自注意力池化层对所得到的氨基酸特征向量序列进行自适应的聚合以得到序列级的特征表示，最后使用多层感知器对毒力因子进行识别。本发明技术方案使用预训练语言模型提取的氨基酸序列初始特征，解决了传统机器学习方法依赖于手工特征和表达能力受限的问题；基于自注意力机制的Transformer模型的编码器
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN118098372A
(43)申请公布日2024.05.28
(21)申请号202410489566.9
(22)申请日2024.04.23
(71)申请人华东交通大学
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