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表观遗传记忆的维持和清除机制

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第一部分DNA甲基化维持机制 2

第二部分组蛋白修饰维持机制 4

第三部分非编码RNA介导的维持机制 6

第四部分DNA甲基化的消除机制 9

第五部分组蛋白修饰的清除机制 11

第六部分非编码RNA介导的清除机制 14

第七部分维持和清除机制的相互作用 16

第八部分表观遗传记忆稳定性的调控 19

第一部分DNA甲基化维持机制

关键词

关键要点

【DNA甲基化维持机制】：

1.半保留复制：DNA复制过程中，新合成链上的CpG岛甲基化状态主要由亲代链甲基化模板决定，保证甲基化模式的继承。

2.DNMT酶：DNA甲基转移酶（DNMT）维持DNA甲基化，其中DNMT1在DNA复制后稳定维持亲代链甲基化，DNMT3A和DNMT3B参与新合成链的甲基化。

3.UHRF家族蛋白：UHRF1和UHRF2识别半甲基化的CpG位点，招募DNMT1至亲代链，促进DNMT1维持甲基化模式。

【DNA甲基化清除机制】：

DNA甲基化维持机制

DNA甲基化是表观遗传修饰的一种形式，涉及在胞嘧啶-鸟嘌呤（CpG）二核苷酸上添加甲基（CH3）基团。DNA甲基化维持机制对于染色质结构和基因表达的稳定性至关重要。

维持甲基化的机制

*DNMT1:甲基转移酶1(DNMT1)是主要的维持甲基化的酶。它优先识别半甲基化的CpG位点，并在新合成的无甲基链上添加甲基。这种对称甲基化模式会随着每次细胞分裂而保持下去。

*DNMT3A和DNMT3B:甲基转移酶3A和3B(DNMT3A和DNMT3B)是一对从头甲基化的酶，主要参与合子发生和胚胎发育过程中建立新的甲基化模式。然而，它们也可以在维持已有的甲基化模式中发挥作用。

*UHRF1:泛素化蛋白同源物1(UHRF1)是一个与DNMT1相关的蛋白，促进其对半甲基化的CpG位点的亲和力。这种相互作用增强了DNMT1的维持甲基化能力。

*HP1γ:异染色质蛋白1γ(HP1γ)是一种染色质相关蛋白，与甲基化的CpG位点结合。HP1γ的结合招募DNMT1，促进维持甲基化。

去甲基化的机制

尽管DNA甲基化通常被认为是稳定的表观遗传修饰，但它可以通过几个机制进行逆转，例如：

*TET酶：TET1、TET2和TET3是氧化酶，可以将5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲酰胞嘧啶(5foC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)。这些氧化产物随后可以被胸腺嘧啶脱氨酶(TDG)去除，从而导致去甲基化。

*AID/APOBEC:活化诱导胞嘧啶脱氨酶(AID)和载脂蛋白BmRNA编辑催化多肽(APOBEC)是一组脱氨酶，可以将胞嘧啶脱氨成尿嘧啶。尿嘧啶随后可以被DNA糖基化酶切除，从而导致去甲基化。

*单碱基切除修复(BER)：BER是一种DNA修复机制，可以去除碱基损伤，包括氧化产物。BER途径可以协同TET酶和AID/APOBEC，促进5mC的去除。

甲基化维持和去甲基化的平衡

DNA甲基化维持和去甲基化的平衡对于基因表达的动态调控至关重要。这种平衡受多种因素影响，包括：

*细胞类型和发育阶段：DNA甲基化模式因细胞类型和发育阶段而异。一些区域在所有细胞中都高度甲基化，而其他区域只在特定细胞类型或发育阶段中甲基化。

*环境因素：环境因素，例如营养缺乏、毒素和压力，可以影响DNA甲基化模式。这些变化可以导致基因表达失调，并与多种疾病有关。

*表观遗传调控因子：表观遗传调控因子，例如组蛋白修饰蛋白和非编码RNA，可以影响DNA甲基化的维持和去甲基化。这些因子共同调节染色质结构和基因表达。

意义

DNA甲基化维持机制对于维持基因组完整性和调控基因表达至关重要。甲基化维持和去甲基化之间的动态平衡允许基因组对环境变化做出反应，并调节从胚胎发育到人类疾病的广泛生物学过程。对于DNA甲基化维持机制的深入理解对于开发新的表观遗传疗法至关重要，这些疗法可以靶向多种疾病，包括癌症和神经退行性疾病。

第二部分组蛋白修饰维持机制

组蛋白修饰维持机制

组蛋白修饰维持机制在表观遗传记忆的维持中起着至关重要的作用。这些机制确保了表观遗传标记在细胞分裂过程中正确地传递给子代细胞，从而维持基因表达模式的稳定性。

组蛋白甲基化维持

组蛋白甲基化由组蛋白甲基转移酶催化，涉及添加或去除甲基。H3K4me3和H3K27me3是重要的激活和抑制性标记，它们的维持至关重要。

*H3K4me3维持：此标记由SET1/COMPASS复合物和其他甲基转移酶维持。PR