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Q-PCR实验流程
一、总RNA抽提
细胞培养皿中细胞样品用1XPBS洗两次后,用1ml枪将PBS吸干净,加入1ml
Trizol(invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5mlRNasefreeEP管中使细
胞充分裂解,室温静置5min;
组织样品用液氮充分研磨,加入1mlTrizol(Invitrogen)溶液,混匀,室温放
置5min使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)
加入200μl氯仿(5X),剧烈振荡混匀1min,使水相和有机相充分接触,室
温静置3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序
排好,与第一步的顺序一致)
4℃下,14000g离心5min,可见分为三层,RNA在上层水相,移至另一个新
的RNasefreeEP管;(用20-200ul的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面
上层吸取上清,枪头不可碰到、吸到中间层)
沉淀RNA:加入等体积(1:1)异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次)(不应用
振荡器混匀),室温静置10min;
4℃下,14000g离心15min,收集RNA沉淀(如离心后仍不见EP管底部有沉淀,
应将EP管放置在-80度冰箱过夜,继续在4℃下,14000g离心10min,收集RNA
沉淀),去上清;
用75%乙醇洗涤两次,12000g离心5min(加入乙醇后只需轻轻颠倒EP管即可,
不用振荡器震荡或枪头吸打沉淀),弃去上清液,空甩一次,以完全去除乙醇,
开盖晾3~5min,反复2次,挥干,使样品变透明。
视沉淀量加入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。,打散,备用。
OligdTRNADEPC
OligdT
RNADEPC水
1ul
4ul
3ul
在RNasefree的PCR管中配置下列溶液.
将上述溶液吹打均匀,置70℃保温5min,使RNA变性。随后4℃,保持5min,
以防止RNA复性;
在该PCR管中加入下列试剂
(M-MLVReverseTranscriptate)E
(M-MLVReverseTranscriptate)E
dNTP
Mgcl
1ul
4ul
3ul
2
M-MLVRT5Xbuffer
4ul
将上述20μl反应溶液混匀,空甩,开始反转录:25℃保温10min;
42℃保温60min;
70℃保温15min;
4℃,∞。三、调cDNA浓度
反转结束后,每个样品加入80ul的超纯水,混匀,用微量分光光度计检测浓度,先用超纯水校准。
20ul(cDNA)+80ul超纯水→100ul(cDNA)然后将各样品的cDNA浓度调至150ng/ul.
初始浓度X100=150X(水+100)
加水量=初始浓度X100/150–100.
四、PCR:
酶E
酶E
模版引物水
10ul
2
ul
20ul体系
2.5ul
5.5ul
离心甩匀后,放入PCR扩增器中,设置反应体系。
五.电泳
配胶:1.5%
80ml1XTBE+1.2g琼脂
微波3min,使之澄清,加入8ulGelred摇匀(与TBE1:10000),加入板上,排除气泡,放入梳子,静置。
垂直拔出梳子,倒入TBE使之没过所有孔,上样,注意每行预留Marker位置,加样完成后,120V跑胶。
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