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《实用生物信息技术》选课题

1．填空

瑞典植物学家林奈于18世纪一方面提出以植物的生殖器官进行分类的方法。

英国博物学家达尔文于1859年发表《物种起源》提出了生物进化论学说。

奥地利学者孟德尔根据豌豆杂交实验结果，揭示了孟德尔遗传定律。

美国遗传学家摩尔根以果蝇为实验材料，创建了基因的连锁互换定律。

DNA分子双螺旋模型由沃森和克里克于1953年提出，论文共2页，发表在nature杂志上。

现代智人的英文名为homosapens，拉丁文学名为homo，

其生物分类学地位为动物界脊索动物门哺乳纲灵长目人科人属智人种。

拟南芥是2年生草本植物，植株高约7-40厘米，其拉丁文学名为Arabidopsis_thaliana

其生物分类学地位为植物界被子植物门双子叶植物纲十字花目十字花科_鼠耳芥属拟南芥种。

与人亲缘关系最近的物种是黑猩猩，英文名Pantroglodytes，有48条染色体，与人分歧约为800百万年。Nature：人与大猩猩进化分歧提前200万年生物谷

Nature：人与大猩猩进化分歧提前200万年

生物谷

人类基因组计划拟定的模式生物为大肠杆菌酵母菌秀丽线虫果蝇小鼠拟南芥水稻

已经完毕基因组测序的植物涉及水稻拟南芥毛果杨。

人类基因组有23对染色体，约含30亿个碱基对，其中蛋白质编码序列约占1.5%，约编码2.5万个蛋白质；人类基因组计划拟定的模式生物涉及大肠杆菌酵母菌秀丽线虫果蝇小鼠拟南芥水稻。

用英文单字符/三字符表达：苏氨酸T/Thr精氨酸R/Arg谷氨酰胺O/Gln组氨酸H/His，带负电氨基酸E/Glu、D/Asp，带芳香环氨基酸Y/Tyr、W/Trp、F/Phe。

蛋白质一级结构指多肽链上氨基酸的排列顺序，二级结构基本单元涉及α螺旋β折叠β转角无规则卷曲，结构域是介于二级结构三级结构之间的结构单位；常见蛋白质复合体涉及为微管、微丝和中间纤维。

人血红蛋白由2个?亚基和2个?亚基组成，共结合4个血色素分子；?亚基编码基因有2个，位于16号染色体，有1个内含子，?亚基编码基因有3个，位于11号染色体，有2个内含子。

小鼠免疫球蛋白IgG由4条肽链组成，涉及2条轻链、2条重链，每条轻链有2结构域，每条重链有4个结构域，轻链和重链之间2对二硫键，重链和重链之间有1对二硫键。

蛋白质一级结构相邻氨基酸残基之间通过肽键连接，而非相邻氨基酸残基之间可通过二硫键连接；决定蛋白质主链走向的二面角为φ和ψ；二面角取值范围与肽平面旋转的空间位阻有关。

维系蛋白质分子空间构象的作用力涉及范德华力氢键疏水作用力盐键二硫键。

组成DNA分子的基本单元为脱氧核苷酸，由脱氧核糖核苷和磷酸组成。脱氧核糖核苷涉及五碳糖和碱基两部分。碱基分两类，一类为嘌呤，涉及腺嘌呤和鸟嘌呤；另一类为嘧啶，涉及胞嘧啶和胸腺嘧啶。

两个单链DNA分子通过碱基互补配对形成双螺旋，若正链为5’-GCCTAGGC-3’，则负链为5’-CGGATCCG-3’；该序列片段具有回文结构。DNA双螺旋中

遗传密码一共有64个，涉及3个终止密码子UAA、UAG、UGA；起始密码子为AUG，也可用于编码蛋氨酸；亮氨酸有6套密码子，丙氨酸有4套密码子，半胱氨酸有2套密码子，色氨酸有1套密码子。

常见RNA分子涉及mRNA、tRNA、rRNA，其中mRNA用来编码蛋白质，tRNA在蛋白质合成过程中转运氨基酸，核糖体与rRNA形成大分子复合物，是蛋白质合成的场合。

微小RNA（microRNA）长度约21-23个碱基，其前体双链RNA通常具有帽子结构，经核酸酶剪切分割成为单链，并和RNA诱导产生的沉默复合体结合而最终作用于靶标，抑止基因表达。

基因表达的调控涉及转录水平调控、翻译水平调控、碱基修饰等；转录因子是一类蛋白质分子，通过与基因上游启动区域特异结合，激活或克制基因转录。

常见蛋白酶有胃蛋白酶、胰蛋白酶，常见蛋白激素有胰岛素、生长素，常见防卫蛋白有抗体、溶菌酶，常见储藏蛋白有谷蛋白，常见有膜蛋白离子通道蛋白、G蛋白、载体蛋白

蛋白质分子中用作辅助因子的常见金属元素涉及Fe、Cu、Mg、Zn。

2.简述（或用图示）分子生物学中心法则

中心法则表达了遗传信息的传递方向：1遗传信息可以通过母代DNA通过自我复制的方式传递给子代DNA。