数据差异甲基化分析说明.pdfVIP

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CGGA_methylation:CGGA数据库中原始的全部样本的

甲基化谱,原始数据中含有空格/Tab需要将值换

为0

CGGA_methylation_OS_1.txt

(CGGA_methylation_OS_1.txt):保留疾病类型III级

和IV级、OS小于一年(大于三年)、去掉SecGBM类

的样本,分别有27和10.

CGGA_methylation_result:两个样本合并并进行log2

转化.

CGGA_methylation_nolog_result.txt:未进行log2转化

的与时间相关的样本甲基化谱(已经匹配完的)

CGGA_methylation_result.txt:经过log2转化的甲基化

CGGA_methylation_uni_result.txt:一个对应多个

甲基化,取其均值确定每个的唯一甲基化值

CGGA_methylation_uni_result.xlsx:SAM软件能够识别

的格式

SAM_master.xlsx:SAM软件的分析结果

CGGA_mathylation_mad.txt:对去重后的计算中

位数绝对偏差,每个甲基化数据的离散性

(mad值过高,数据的波动越大,阈值设为mad0.5)

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