PCR设计引物原则.docx

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①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。

②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。

③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易消灭非特异条带。ATGC最好随机分布,避开5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

④避开引物内部消灭二级构造,避开两条引物间互补,特别是3’端的互补,否则会形

成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。

⑤引物3’端的碱基,特别是最末及倒数其次个碱基,应严格要求配对,以避开因末端碱基不配对而导致PCR失败。

⑥引物中有或能加上适宜的酶切位点,被扩增的靶序列最好有

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