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原核生物蛋白质基因组学研究进展

张成普,徐平,朱云平.原核生物蛋白质基因组学研究进展.生物工程学报,2014,30(7):1026−1035.

ZhangCP,XuP,ZhuYP.Progressinproteogenomicsofprokaryotes.ChinJBiotech,2014,30(7):1026−1035.

摘要:随着基因组测序技术的不断发展，大量微生物基因组序列可以在短时间内得以准确鉴定。为了进一步探

究基因组的结构与功能，基于序列特征与同源特征的基因组注释算法广泛应用于新测序物种。然而受基因组测序质

量以及算法本身准确性偏低等问题的影响，现有的基因组注释存在着相当比例的假基因以及注释错误，尤其是蛋白

质N端的注释错误。为了弥补基因组注释的不足，以基因芯片或RNA-seq为核心的转录组测序技术和以串联质谱

为核心的蛋白质组测序技术可以高通量地对基因的转录和翻译产物进行精确测定，进而实现预测基因结构的实验验

证。然而，原核生物细胞中存在的大量非编码RNA给转录组测序技术引入了污染数据，限制了其对基因组注释的

应用。相对而言，以串联质谱技术为核心的蛋白质组学测序可以在短时间内鉴定到生物体内大量的蛋白质，实现注

释基因的验证甚至校准。已成为基因组注释和