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compass力场简介(最新整理版).pdfVIP

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IntroductiontoCOMPASSForcefield

LiangTaining,YangXiaozhen

(CenterforMolecsclarScience,InstituteofChemistry,Beijing100080)

AbstratCOMPASSforcefieldisthenewkindforcefielddevelopedfor

theCondensed-phaseOptimizedMolecularPotentials.Itisthefirstab

initioforcefieldthatenablesaccurateandsimultaneouspredictionof

structural,conformational,vibrational,andthermophysicalproperties

forabroadrangeofmoleculesinisolationandincondensedphases.It

isalsothefirsthighqualityforcefieldthatconsolidatesparametersfor

organicandinorganicmaterialspreviouslyfoundindifferentforcefields.

Thisforcefieldincludesthemostcommonorganics,inorganicsmall

molecules,polymers,somemetalions,metaloxidesandmetals.

KeywordsCOMPASS,Molecularforcefield

摘要COMPASS力场是最近发展的适合凝合态应用的一个全新的分子力场。它是第

一个基于从头计算、能够精确预报孤立态和凝合态分子的分子结构、构象、振动、

热力学性质的分子力场。COMPASS力场也是第一个把以往分别处理的有机分子体

系的力场与无机分子体系的力场统一的分子力场,能够模拟有机和无机小分子,

高分子,一些金属离子、金属氧化物与金属。

关键词COMPASS分子力场

分子力场——COMPASS简介*

梁太宁杨小震**

(中国科学院化学探讨所分子科学中心100080)

在分子模拟中常常要模拟成千上万个原子的分子体系。明显,与量子力

学和半阅历方法相比,分子力学有实力处理大分子体系并且可以大大节约计算时

间。分子力学是从经典力学的观点来描述分子中原子的拓扑结构。它是通过分子

力场(molecularforcefield),这个分子模拟的基石来实现的。分子力场是原子

尺度上的一种势能场,是由一套势函数与一套力常数构成的。由此描述特定分子

结构的体系能量。该能量是分子体系中成键原子的内坐标的函数,也是非键原子

对儿距离的函数[1]。最早分子力学的方法好像可以追朔到双原子分子的振动光谱

的计算。分子力学方法系统地发展还是在50年头以后。通过选择一套势函数和从

试验中得到的一套力常数,从给定的分子体系原子的空间坐标的初值,用分子力

场描述的体系总能量对原子坐标的梯度,就可以通过多次迭代的数值算方法来得

到合理的分子体系的结构。这样一个在物理上非常清晰的方法能否用到材料科学

领域,关键在于分子力场能否描述广泛的材料分子。

分子力场近年来的发展[2-5]才使分子力学有了用武之地,计算机模拟方法,使

不便区分化学特征的理论物理探讨小组,进入了能在化学上区分的各种材料的分

[6][7][8]

子设计试验室。早期的分子力场,如CFF,MM2,MMP2,AMBER,CHARMM,等,

仅能够描述有限的几种元素与一些轨道杂化的原子。在物理化学探讨领域虽有很

多的应用,但还不能满意材料科学发展的须要。90年头以来发展的

MM3/MM4[9](Allingeretal1989-1996),D

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