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4个香菇品种的AFLP分子标记研究
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雷萍张文隽吴亚召王磊赵玉鹏任宏飞
摘要??试验以香菇LB-21、香菇L808、香菇215和香菇B15-1等4个品种为研究材料,采用AFLP分子标记技术分析其遗传多样性。结果表明,4个香菇品种之间的遗传相似性系数变化范围为0.6695~0.8787;UPGMA法聚类分析发现,4个品种分为2组,香菇LB-21与香菇B15-1亲缘关系较近,遗传相似性系数为0.8745,香菇L808与香菇215亲缘关系较近,遗传相似性系数为0.8787。
关键词??香菇;AFLP分子标记;遗传多样性;聚类分析
??S646.12??????A??????1007-5739(2019)09-0047-02
Abstract??ThegeneticdiversityofLB-21,L808,215andB15-1LentinusedodesvarietieswasanalyzedbyAFLPmolecularmarker.TheresultsshowedthatthevariationrangeofgeneticsimilaritycoefficientamongthefourLentinusedodesvarietieswas0.6695-0.8787.UPGMAclusteringanalysisshowedthatthefourvarietiesweredividedintotwogroups,LB-21andB15-1werecloselyrelated,andthegeneticsimilaritycoefficientwas0.8745.L808and215werecloselyrelated,andthegeneticsimilaritycoefficientwas0.8787.
Keywords??Lentinusedode;AFLPmolecularmarker;geneticdiversity;clusteringanalysis
香菇(Lentinusedodes(Berk.)sing)又名香蕈、冬菇、花菇、椎茸等,在分类学上隶属于担子亚门层菌纲伞菌目侧耳科香菇属[1]。其味道鲜美,营养丰富,药用价值较高,是世界第二大食用菌,也是世界真菌学家研究的热点。我国香菇栽培历史悠久,栽培面积逐年增加,菌种选育和栽培技术研究等工作受到了科研工作者的重视。香菇菌种是香菇产业化发展的重要基础,决定了其产量和质量。从分子生物学水平鉴定菌种和构建DNA指纹图谱有助于准确识别菌种,从而有效地利用不同香菇品种的优势,促进香菇生产的发展[2]。
目前,应用于香菇种质资源研究的分子标记主要有SSR、AFLP、RAPD、SCAR、SRAP[3-7]。AFLP分子标记技术具有模板量少、引物通用性高、多态检出率高、稳定性和重復性较强等优点,广泛应用于植物分子遗传图谱构建、遗传多样性及亲缘关系研究、基因定位和分子标记辅助育种等研究领域[8-9]。本试验利用AFLP分子标记技术分析不同香菇品种的遗传多样性,从基因水平反应品种之间的关系,为进一步开展香菇生物学研究提供一定的试验依据。
1??材料与方法
1.1??试验材料
供试香菇品种共4个,即香菇LB-21、香菇L808、香菇215和香菇B15-1,均来自陕西省微生物研究所微生物菌种资源中心第三研究室。香菇LB-21是选育品种,抗霉菌能力强、产量高,经小面积栽培产量稳定;香菇L808是广温型品种,菇体中等偏大、菇形圆整、菇柄较短、菇质优、菌龄短,产量高;香菇215是中高温型品种,菌肉厚实,菌柄中长偏短,抗逆性强,产量高;香菇B15-1是野生香菇菌株,抗杂菌污染能力强,柄短肉厚。
1.2??主要试剂及引物
主要试剂有Taq酶(2U/μL)、dNTP(10mmol/L)、引物(10mmol/L)(生工基因)、内切酶(10U/μL)(NEB公司)、T4连接酶(5U/μL)(NEB公司)。Marker为DL2000、100bpDNALadder。引物在北京六合华大基因科技有限公司合成。试验所用接头和引物信息见表1,试验所用引物组合见表2。
1.3??试验方法
1.3.1??样品DNA提取。采用改良CTAB法进行DNA提取,用2.0%琼脂糖凝胶电泳检测。
1.3.2??限制性内切及连接。对所选样品采用EcoRⅠ/MseⅠ双酶切,酶切与连接反应同步进行。酶切与连接体系(20μL)为:10×AFLPdigest-l
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