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基于网络药理学研究络石藤-伸筋草药对治疗骨关节炎的作用机制
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蒋涛孔博颜威吴昌桂徐醒江敏奚小冰
摘要目的:運用网络药理学方法研究络石藤-伸筋草药对治疗骨关节炎的生物活性成分和潜在的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)和中国科学院化学专业数据库(CASC)中收集已知的络石藤-伸筋草药对中的生物活性化学成分;使用SwissTargetPrediction网络服务器预测化合物的蛋白靶点;从疾病数据库中挖掘已知的骨关节炎相关靶点数据;利用收集到的数据分别构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并提取其交集作为药物-疾病相互作用网络,通过网络拓扑学分析筛选出核心靶点;使用DAVID数据库对核心靶点进行GO注释分析和KEGG通路分析。结果:从TCMSP和CASC数据库中共收集到108个已知的络石藤-伸筋草药对中的化学成分,虚拟筛选后得到17个生物活性化合物,并预测出117个潜在的蛋白靶点;从疾病数据库中一共检索到191个骨关节炎相关靶点;对化合物和疾病的交集PPI网络进行网络拓扑学分析得到208个核心靶点,这些靶点主要富集到自噬、凋亡、炎性反应、雌激素相关的生物过程和信号通路。结论:络石藤-伸筋草药对可能通过多条生物途径发挥调节炎性反应、自噬、凋亡和类雌激素样作用发挥抗骨关节炎作用。
关键词网络药理学;络石藤;伸筋草;药对;骨关节炎
PotentialMechanismofHerbPairCaulisTrachelospermiandHerbaLycopodiionOsteoarthritisBasedontheNetworkPharmacologyStudy
JIANGTao1,2,KongBo1,2,YANWei1,2,WUChanggui1,2,XUXing2,JIANGMing2,XIXiaobing1,2
(1ShanghaiRuijinHospital,ShanghaiJiaotongUniversitySchoolofMedicine,Shanghai20025,China;2ShanghaiKeyLaboratoryofPreventionandCureofBoneandJointDiseasebyCombinedChineseandWesternMedicine,Shanghai20025,China)
AbstractObjective:Toexcavatethebio-activecompoundsandpotentialmolecularmechanismfortheherbpairCaulisTrachelospermiandHerbaLycopodiionosteoarthritis(OA)basedonthenetworkpharmacologymethod.Methods:Knownbioactive-ingredientsoftheofherbpairwereobtainedfromtheChineseMedicineSystemPharmacologyDatabaseandAnalysisPlatform(TCMSP)andtheShanghaiInstituteofOrganicChemistryofCAS,ChemistryDatabase(CASC)withtheirpotentialtargetspredictedbytheSwissTargetPredictionserver.KnownOA-relatedgeneswereminedindiseasedatabases;protein-proteininteraction(PPI)networkwasconstructedwiththecollecteddata,andtheirintersectionwasextractedasdrug-diseaseinteractionnetwork;coregenetargetswerescreenedthroughnetworktopologyanalysis.KyotoEncyclopediaofGenesandGenomessignalingpathwayanalysisandGeneontologyanalysiswereperformedtorevealgenefunctionby
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