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ICS11.100
CCSC44
团体标准
T/SZASXXXX—XXXX
单基因遗传病临床全外显子组测序性能验
证及室内质控规程
Validationandinternalqualitycontrolofclinicialwholeexomesequencing
(征求意见稿)
在提交反馈意见时,请将您知道的相关专利连同支持性文件一并附上。
XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施
深圳市标准化协会 发布
T/SZASXXXX—XXXX
单基因遗传病临床全外显子组测序性能验证及室内质控规程
1范围
本文件规范了临床全外显子组测序性能验证及室内质量控制(室内质控)的过程,涵盖检测性能和
室内质控的要求、性能确认的过程、方法和评估要求等。
本文件旨在为检测服务提供商及提供相关检测的各类检测机构,在开展全外显子组测序对人类基因
组进行单基因遗传病变异检测时的质量控制程序提供规范性建议,包含但不局限于运行前性能确认及运
行中室内质控的流程及要求,覆盖范围包括但不限于实验操作、数据分析、结果判读以及报告出具过程。
适用于以大规模并行测序技术为技术路线的单基因遗传性疾病全外显子组测序,适用于该类型检测
服务提供商及提供相关检测的各类检测机构。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本
文件。
GB/T19703—2020/ISO15194:2009体外诊断医疗器械生物源性样品中量的测量有证参考物质
及支持文件内容的要求
GB/T35890—2018高通量测序数据序列格式规范
GB/T42751—2023信息技术生物特征识别高通量测序基因分型系统规范
GA/T1693—2020法庭科学DNA二代测序检验规范
T/CHIA21.2—2021组学样本处理与数据分析标准第2部分:全外显子组测序数据分析
T/SZAS13—2019基因组学数据集
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
高通量测序high-throughputsequencing
能够一次并行对大量核酸分子进行平行序列测定的技术,通常一次测序反应能产生不低于100M碱基
对的测序数据。
[来源:GB/T42751—2023,3.1]
3.2
外显子组exome
个体基因组中能够编码产生蛋白质氨基酸序列的DNA区域的总和,在人类基因组中往往呈不连续的
片段分布,占整个人类基因组的1~2%。
3.3
全外显子组测序wholeexomesequencing,WES
利用探针杂交富集外显子区域的DNA序列,然后通过高通量测序,主要识别和研究与疾病、种群进
化相关的编码区及其调控区域相关遗传突变的技术手段。
[来源:T/CHIA21.2—2021,3.3,有修改]
3.4
临床全外显子组测序clinicalwholeexomesequencing;cWES
1
T/SZASXXXX—XXXX
利用序列捕获技术将外显子区域捕获并富集后进行高通量基因测序,针对公共数据库(如OMIM数据
库)中明确致病的基因,对获得的全外显子组数据进行单基因遗传病相关
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