山葡萄北冰红VvCOR413-I1基因克隆及生物信息学分析.docx

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山葡萄北冰红VvCOR413

I1基因克隆及生物信息学分析

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王学娟

摘要[目的]从山葡萄北冰红中克隆耐寒基因COR413，并对其功能进行生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR法克隆山葡萄北冰红基因COR413，并利用生物信息学对其进行分析。[结果]它包括630bp完整的开放阅读框，推测编码210个氨基酸，蛋白的分子量（MW）为59.18kD，等电点（pI）值为10.74。其蛋白结构以α-螺旋、延伸链为主，其次为无规则卷曲，β-转角所占比例最少，含有4个跨膜结构域。多重序列比对表明VvCOR413-I1与其他植物COR413的氨基酸序列相似性为63.00%～68.33%。[结论]该研究为深入了解VvCOR413-I1功能奠定了基础。

关键词冷适应蛋白基因（COR413）；山葡萄北冰红；克隆；生物信息学分析

S188

A0517-6611（2018）14-0109-04

CloningandBioinformaticAnalysisofVvCOR413-I1GenefromBeibinghongAmurGrape

WANGXuejuan（CollegeofLifeScience，InnerMongoliaUniversityforNationalities，Tongliao，InnerMongolia028000）

Abstract[Objective]ThecoldtolerantgeneCOR413wasclonedfromtheBeibinghongAmurgrape，anditsfunctionwasinferredthroughbioinformaticsanalysis.[Method]TheRTPCRmethodwasusedtocloneCOR413，acoldtolerantgenefromtheBeibinghongAmurgrape，anditsmolecularcharacteristicswereanalyzedbybioinformaticstoinferthefunctionofCOR413gene.[Result]TheORFofCOR413was630bpandthededucedaminoacidsequencewas230aminoacids.Furthermore，itsproteinhadaMWof59.18kDandanisoelectricpoint（pI）of10.74.Thestructureoftheproteinwasdominatedbyαhelixandelongationchain，followedbyrandomcoil，theproportionofβturnwasthesmallest，containing4transmembranedomains.MultiplesequencealignmentshowedthattheaminoacidsequencesimilarityofCOR413withotherplantswas63.00%to68.33%.[Conclusion]ThestudylaidthefoundationforanindepthunderstandingofVvCOR413I1function.

KeywordsColdregulatedgene（COR413）；BeibinghongAmurgrape；Clone；Bioinformaticanalysis

溫度胁迫是重要的非生物胁迫因子之一，其对植物的生长发育、花期、果期等产生重要的影响。植物接受不利温度的逆境信号后，通过信号传导途径，调节细胞内胁迫蛋白的表达。冷适应蛋白（coldregulated，COR413）基因作为植物特有的一类低温胁迫响应功能基因，在抗寒过程中发挥重要作用。冷驯化拟南芥转录组研究表明，COR413基因受低温调控，被称为低温诱导基因[1-2]。在植物COR413基因中含有CRT元件，CRT元件与CBF相互结合后引起COR413的表达，但是CBF的调控受到ICE的调控，ICE是一种组成型表达的蛋白质，但是蛋白质的泛素化是通过磷酸化来进行识别和调控的[3-4]。植物耐寒COR413已在多种植物中被克隆出来，并进行了功能验证。植物耐寒分子机制是一个复杂的过程，由多个基因协同作用在耐寒信号通路以抵御冷害，但有报