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几种常用实验动物与人肠道主要菌群多样性比较的

开题报告

一、研究背景

肠道菌群对于人体健康意义重大，与人体营养、免疫、代谢和神经

系统等多方面密切相关。为了深入了解肠道菌群多样性的变化及其健康

影响，需要开展基础实验研究。

实验动物作为肠道菌群研究的重要模型，已经广泛应用于肠道菌群

的多样性研究。然而，由于种系、饲料、环境等因素的影响，动物模型

与人体情况仍存在一定差异。因此，比较实验动物与人体肠道菌群多样

性的异同，可以增强我们对于肠道菌群多样性研究的认知和实验动物模

型的可靠性。

二、研究目的

本研究旨在比较几种常用实验动物（小鼠、大鼠、豚鼠、猪）与人

体的肠道菌群多样性差异，为深入探究肠道菌群及其与健康关系提供参

考。

三、研究方法

1.动物样本获取

收集实验动物（小鼠、大鼠、豚鼠、猪）及人体粪便样本。

2.粪菌DNA提取

采用盐水离子提取法或者基于磷酸盐缓冲液的菌群DNA提取法，提

取样本中的粪菌DNA。

3.全长16SrDNAPCR扩增

使用16SrRNA基因区域通用引物扩增。通过扩增出的16SrDNA序

列实现对菌群样本的DNA鉴定。

4.扩增子测序和序列分析

将PCR扩增得到的产品进行Sanger测序或高通量测序，使用序列，

如QIIME、MEGA等，进行序列分析，包括序列清理、序列比对、进化树

构建、分类学注解等。

5.数据分析

对于多样性数据，采用基于OTU或ASV的Alpha和Beta多样性分

析方法，在物种多样性水平和群体差异水平进行统计分析。

四、研究预期结果

本研究将比较几种常用实验动物与人体的肠道菌群多样性异同，预

计可以得出以下结论：

1.其中，不同实验动物与人体肠道菌群群落多样性存在不同程度的

差异，并且各物种肠道菌群的群落结构和菌属组成也具有较大差异。

2.多样性差异的原因可能与饲料种类、种系、环境等生态因素密切

相关。同时，不同实验动物肠道与人体肠道菌群间的共生关系也存在异

同。

3.本研究结果将为深入探究肠道菌群与宿主健康关系提供参考，同

时也为确定合适的实验动物模型提供一定依据。

五、研究意义

本研究旨在比较几种常用实验动物与人体肠道菌群多样性差异，有

助于深入了解肠道菌群的多样性变化和生态功能，以及体内微生物与健

康关系的科学问题。同时，通过对实验动物与人体肠道菌群间的异同比

较，还能确定适用于人体的实验动物模型，为肠道微生物研究提供关键

参考。