基于变分图自动编码器的空间转录组数据去卷积方法.pdf

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摘要

摘要

单细胞转录组(scRNA.seq)测序能够在单个细胞的分辨率上表示转录组学

图谱,而空间转录组学(spatialtranscriptomics)作为单细胞转录组学的延伸,其

能够将组织切片中不同点的空间信息与每个点内细胞的核糖核酸丰度联系起来,

这对于理解组织细胞结构和功能尤为重要。然而对于空间转录组数据而言,由于

空间转录组的采样点通常含有多个单细胞,所以在每个采样点所测量的基因表达

是来自具有不同细胞类型的细胞的混合物。因此,我们利用深度学

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