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LIGGGHTS的二次开发基础
1.LIGGGHTS简介
LIGGGHTS(LImitedGranularGeoHydroThermodynamicSimulator)是一个开源的离散元模拟软件,主要用于模拟颗粒材料的力学行为。它基于LAMMPS(Large-scaleAtomic/MolecularMassivelyParallelSimulator)开发,继承了LAMMPS的高性能计算能力和并行处理能力。LIGGGHTS广泛应用于材料科学、工程力学、化工、制药等领域,可以模拟从微观到宏观尺度的颗粒系统,包括粉体、砂土、颗粒流等。
LIGGGHTS的核心功能包括:-颗粒运动的模拟-颗粒间的相互作用-外部力场的施加-多物理场耦合模拟
LIGGGHTS的二次开发是指在原有软件的基础上,通过增加自定义的模块、修改现有功能或优化性能来满足特定研究或工业应用的需求。二次开发可以使LIGGGHTS更加灵活,适应更多的应用场景。
2.LIGGGHTS的安装与配置
2.1安装LIGGGHTS
LIGGGHTS可以通过多种方式进行安装,包括从源代码编译安装和使用预编译的二进制包。以下是使用源代码编译安装LIGGGHTS的步骤:
下载源代码访问LIGGGHTS的官方网站或GitHub仓库,下载最新版本的源代码。
gitclone/CFDEMproject/LIGGGHTS-PUBLIC.git
cdLIGGGHTS-PUBLIC
安装依赖项LIGGGHTS依赖于一些外部库,如MPI、FFTW等。确保这些库已经安装在您的系统中。
sudoapt-getupdate
sudoapt-getinstallcmakegfortranmpichlibfftw3-dev
配置编译选项使用CMake配置编译选项。您可以选择是否启用并行计算、图形输出等功能。
mkdirbuild
cdbuild
cmake..-DMPICH_PATH=/usr/lib/mpich-DFFT3D=ON
编译源代码编译源代码并生成可执行文件。
make-j4
验证安装运行一个简单的测试案例来验证LIGGGHTS是否安装成功。
cd../examples/DEM/basic
../../build/liggghtsin.basic
2.2配置开发环境
为了进行LIGGGHTS的二次开发,您需要一个合适的开发环境。以下是配置开发环境的步骤:
安装文本编辑器推荐使用VisualStudioCode、SublimeText或Vim等文本编辑器。
sudoapt-getinstallvisual-studio-code
安装调试工具使用GDB等调试工具可以帮助您更好地进行代码调试。
sudoapt-getinstallgdb
设置编译器确保您的系统中安装了C++编译器,如GCC或Clang。
sudoapt-getinstallgccg++
配置CMake使用CMake来管理项目的构建过程。
sudoapt-getinstallcmake
设置环境变量将LIGGGHTS的可执行文件路径添加到环境变量中。
exportPATH=$PATH:/path/to/liggghts/build
3.LIGGGHTS的基本结构
3.1源代码结构
LIGGGHTS的源代码结构如下:
src:包含LIGGGHTS的核心源代码。
lib:包含第三方库的源代码。
examples:包含示例输入文件和脚本。
doc:包含文档和用户手册。
python:包含Python接口的相关代码。
3.2核心模块
LIGGGHTS的核心模块包括:
pair:定义颗粒间的相互作用力模型。
fix:定义模拟中的约束条件和控制参数。
compute:计算模拟过程中的物理量。
domain:定义模拟区域的几何形状和边界条件。
force:定义外部力场和力的计算方法。
neigh:定义邻域列表的构建方法。
output:定义模拟结果的输出方式。
3.3输入文件格式
LIGGGHTS使用输入文件来定义模拟任务。输入文件通常包含以下几个部分:
初始化设置:定义模拟的基本参数,如模拟区域、时间步长等。
颗粒定义:定义颗粒的类型、属性和初始位置。
力场定义:定义颗粒间的相互作用力模型。
模拟命令:定义模拟的具体步骤,如时间积分、输出结果等。
以下是一个简单的输入文件示例:
unitslj
atom_stylesphere
boundaryppp
#定义模拟区域
region
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