材料模拟软件：LIGGGHTS二次开发_LIGGGHTS的自定义力场与势能函数开发.docx

PAGE1

PAGE1

LIGGGHTS的自定义力场与势能函数开发

在上一节中，我们探讨了LIGGGHTS的基本功能和使用方法。现在，我们将深入讨论如何在LIGGGHTS中开发自定义力场与势能函数，这将使您能够模拟更复杂的材料系统，满足特定的研究需求。

自定义力场的基本原理

LIGGGHTS（Large-scaleAtomic/MolecularMassivelyParallelSimulator）是一款基于分子动力学（MD）的模拟软件，广泛用于模拟颗粒系统。力场和势能函数是分子动力学模拟的核心，它们定义了系统中粒子之间的相互作用。LIGGGHTS提供了多种内置力场，但有时这些力场可能无法满足特定的研究需求。因此，开发自定义力场和势能函数是必要的。

力场的定义

力场是一组数学表达式，用于描述粒子之间的相互作用力。这些力场通常包括以下几个部分：

配位数（CoordinationNumber）：描述粒子周围邻居的数量。

键合势（BondPotential）：描述粒子之间通过键合连接的相互作用。

角势（AnglePotential）：描述三个粒子之间的角度相互作用。

二面角势（DihedralPotential）：描述四个粒子之间的二面角相互作用。

非键合势（Non-bondedPotential）：描述粒子之间的非键合相互作用，如范德华力和库仑力。

势能函数的定义

势能函数是力场的数学表达形式，用于计算粒子之间的势能。势能函数可以是解析形式的，也可以是表格形式的。在LIGGGHTS中，势能函数通常通过以下几种方式定义：

解析势能函数：通过数学表达式直接定义。

表格势能函数：通过预先计算的表格数据定义。

混合势能函数：结合解析和表格形式的势能函数。

自定义力场的开发步骤

开发自定义力场和势能函数需要以下几个步骤：

确定研究需求：明确需要模拟的材料系统和研究目的。

选择力场类型：根据研究需求选择合适的力场类型。

编写势能函数：编写符合研究需求的势能函数。

编译和测试：将自定义力场和势能函数编译到LIGGGHTS中，并进行测试。

优化和调整：根据测试结果优化和调整势能函数。

确定研究需求

在开始开发自定义力场之前，首先需要明确您的研究需求。例如，如果您需要模拟一种特定的纳米材料，可能需要考虑以下几个因素：

材料的化学成分：确定材料中原子的种类和数量。

材料的结构：确定材料的晶格结构或分子结构。

相互作用类型：确定需要模拟的相互作用类型，如范德华力、库仑力、氢键等。

选择力场类型

LIGGGHTS提供了多种力场类型，包括但不限于：

Lennard-Jones力场：适用于模拟惰性气体和简单液体。

EAM力场：适用于模拟金属材料。

Tersoff力场：适用于模拟半导体材料。

REBO力场：适用于模拟碳材料。

选择合适的力场类型是开发自定义力场的关键。例如，如果您需要模拟一种含有碳纳米管的复合材料，可以考虑使用Tersoff力场或REBO力场。

编写势能函数

解析势能函数

解析势能函数通过数学表达式直接定义。以下是一个简单的Lennard-Jones势能函数的示例：

//Lennard-Jones势能函数

doublelj_potential(doubler,doubleepsilon,doublesigma){

doublesr6=pow(sigma/r,6);

doublesr12=sr6*sr6;

return4.0*epsilon*(sr12-sr6);

}

在这个示例中，r是粒子之间的距离，epsilon是势阱深度，sigma是粒子之间的特征距离。

表格势能函数

表格势能函数通过预先计算的表格数据定义。以下是一个表格势能函数的示例：

#文件名:lj_table.dat

#距离（?）势能（eV）

0.000100.000

0.10099.000

0.20096.000

0.30091.000

0.40084.000

0.50075.000

0.60065.000

0.70055.000

0.80045.000

0.90036.000

1.00028.000

1.10021.000

1.20015.000

1.30010.000

1.4006.000

1.5003.000

1.6001.000

1.7000.500

1.8000.200

1.9000.100

2.0000.050

2.1000.020

2.2000.010

2.3000.005

2.4000.002

2.5000.001

在LIGGGHTS中，可以使用pair_styletable命令来读取表格势能函数